Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD9O15198 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD9O15198 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD9O15198 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms