Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QKU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QKU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QKU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QKU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QKU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QKU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QKU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QKU1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QKU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QKU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QKU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QKU1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QKU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QKU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
J3QKU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
J3QKU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QKU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QKU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QKU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QKU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
J3QKU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QKU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QKU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QKU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QKU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QKU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
J3QKU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QKU1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QKU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QKU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
J3QKU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QKU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QKU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QKU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
J3QKU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QKU1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QKU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QKU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QKU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QKU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QKU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QKU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QKU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QKU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QKU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QKU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QKU1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QKU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QKU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QKU1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QKU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QKU1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QKU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QKU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QKU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QKU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QKU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QKU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QKU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QKU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QKU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QKU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QKU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QKU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QKU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QKU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QKU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QKU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QKU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QKU1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QKU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QKU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QKU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms