Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KRW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KRW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KRW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KRW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KRW8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KRW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KRW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KRW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KRW8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KRW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KRW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KRW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KRW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KRW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KRW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KRW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KRW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KRW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KRW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KRW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3KRW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
J3KRW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
J3KRW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3KRW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3KRW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KRW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
J3KRW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KRW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KRW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KRW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KRW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KRW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3KRW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3KRW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KRW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KRW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KRW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KRW8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KRW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
J3KRW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3KRW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3KRW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3KRW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3KRW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3KRW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3KRW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KRW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KRW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KRW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KRW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KRW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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