Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PQ18 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PQ18 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PQ18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PQ18 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PQ18 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PQ18 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PQ18 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PQ18 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PQ18 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PQ18 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PQ18 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PQ18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PQ18 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PQ18 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PQ18 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PQ18 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PQ18 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PQ18 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PQ18 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PQ18 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PQ18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PQ18 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PQ18 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PQ18 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PQ18 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PQ18 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PQ18 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PQ18 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PQ18 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PQ18 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PQ18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PQ18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PQ18 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PQ18 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PQ18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PQ18 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PQ18 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PQ18 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PQ18 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PQ18 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PQ18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PQ18 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PQ18 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PQ18 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PQ18 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PQ18 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PQ18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PQ18 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E9PQ18 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PQ18 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PQ18 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PQ18 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PQ18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PQ18 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PQ18 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PQ18 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PQ18 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PQ18 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PQ18 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PQ18 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PQ18 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PQ18 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PQ18 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PQ18 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PQ18 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PQ18 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PQ18 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PQ18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1860.2 ms