Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH8

HNRNPCL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL2B2RXH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNRNPCL2B2RXH8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNRNPCL2B2RXH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL2B2RXH8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL2B2RXH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL2B2RXH8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL2B2RXH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms