Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC160A6NGH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC160A6NGH7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC160A6NGH7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms