Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LINC01553A4QN01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC01553A4QN01 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC01553A4QN01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC01553A4QN01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC01553A4QN01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms