Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQW1

LOC100506127, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100506127A0A0U1RQW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LOC100506127A0A0U1RQW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOC100506127A0A0U1RQW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms