RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617631.1

5S_rRNA.12-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SLC24A1O60721 1099 aa6.74□□□□□ -1.33
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MYT1Q01538 1121 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 APLP2Q06481 763 aa6.14□□□□□ -1.43
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ARXQ96QS3 562 aa5.99□□□□□ -1.45
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.93□□□□□ -1.46
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EHMT2Q96KQ7 1210 aa5.89□□□□□ -1.47
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLPPR3Q6T4P5 718 aa5.73□□□□□ -1.49
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HOMEZQ8IX15 550 aa5.72□□□□□ -1.49
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.61□□□□□ -1.51
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BCANQ96GW7 911 aa5.6□□□□□ -1.51
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.57□□□□□ -1.52
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KCNA4P22459 653 aa5.56□□□□□ -1.52
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CSRNP3Q8WYN3 585 aa5.54□□□□□ -1.52
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FBXO3Q9UK99 471 aa5.52□□□□□ -1.53
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.47□□□□□ -1.53
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.45□□□□□ -1.54
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DCAF8L2P0C7V8 631 aa5.44□□□□□ -1.54
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KLHL34Q8N239 644 aa5.44□□□□□ -1.54
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BCL11AQ9H165 835 aa5.42□□□□□ -1.54
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.4□□□□□ -1.54
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLCB2Q00722 1185 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.32□□□□□ -1.56
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.32□□□□□ -1.56
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.32□□□□□ -1.56
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C14orf37Q86TY3 774 aa5.3□□□□□ -1.56
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NEFLP07196 543 aa5.24□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLEKHG5O94827 1062 aa5.23□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.22□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.2□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.19□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PDE4CQ08493 712 aa5.14□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HRCP23327 699 aa5.13□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ARID3AQ99856 593 aa5.12□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.11□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.1□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.09□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FGD1P98174 961 aa5.04□□□□□ -1.6
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.04□□□□□ -1.6
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.03□□□□□ -1.6
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa5.01□□□□□ -1.61
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.98□□□□□ -1.61
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.97□□□□□ -1.61
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.97□□□□□ -1.61
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.96□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CLSTN1O94985 981 aa4.95□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NBR1Q14596 966 aa4.95□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FKBP8Q14318 412 aa4.94□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IGSF3O75054 1194 aa4.93□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.93□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TICAM2Q86XR7 235 aa4.92□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.91□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZBTB22O15209 634 aa4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FBLN2P98095 1184 aa4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AAMPQ13685 434 aa4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PSMD1Q99460 953 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PPP6R1Q9UPN7 881 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms