RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.49■■□□□ 1.83
HPS1-215ENST00000613394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.1■■□□□ 1.45
HPS1-215ENST00000613394 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HPS1-215ENST00000613394 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.82■■□□□ 1.4
HPS1-215ENST00000613394 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-215ENST00000613394 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-215ENST00000613394 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.54■■□□□ 1.2
HPS1-215ENST00000613394 HRCP23327 699 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-215ENST00000613394 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS1-215ENST00000613394 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HPS1-215ENST00000613394 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HPS1-215ENST00000613394 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HPS1-215ENST00000613394 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS1-215ENST00000613394 TRIM41Q8WV44 630 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS1-215ENST00000613394 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HPS1-215ENST00000613394 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS1-215ENST00000613394 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HPS1-215ENST00000613394 ABCC9O60706 1549 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-215ENST00000613394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.53■■□□□ 1.04
HPS1-215ENST00000613394 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HPS1-215ENST00000613394 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HPS1-215ENST00000613394 SCRIBQ14160 1630 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS1-215ENST00000613394 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HPS1-215ENST00000613394 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HPS1-215ENST00000613394 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
HPS1-215ENST00000613394 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HPS1-215ENST00000613394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.01■□□□□ 0.95
HPS1-215ENST00000613394 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HPS1-215ENST00000613394 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.98■□□□□ 0.95
HPS1-215ENST00000613394 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
HPS1-215ENST00000613394 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HPS1-215ENST00000613394 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HPS1-215ENST00000613394 APLP2Q06481 763 aa20.9■□□□□ 0.94
HPS1-215ENST00000613394 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HPS1-215ENST00000613394 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
HPS1-215ENST00000613394 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HPS1-215ENST00000613394 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.76■□□□□ 0.91
HPS1-215ENST00000613394 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.74■□□□□ 0.91
HPS1-215ENST00000613394 NEUROD1Q13562 356 aa20.73■□□□□ 0.91
HPS1-215ENST00000613394 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HPS1-215ENST00000613394 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.68■□□□□ 0.9
HPS1-215ENST00000613394 WIZO95785 1651 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-215ENST00000613394 NACADO15069 1562 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS1-215ENST00000613394 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HPS1-215ENST00000613394 ABCC8Q09428 1581 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-215ENST00000613394 CEP162Q5TB80 1403 aa20.52■□□□□ 0.87
HPS1-215ENST00000613394 ITGAEP38570 1179 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-215ENST00000613394 SOGA1O94964 1423 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-215ENST00000613394 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS1-215ENST00000613394 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HPS1-215ENST00000613394 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HPS1-215ENST00000613394 MIER1Q8N108 512 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-215ENST00000613394 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-215ENST00000613394 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-215ENST00000613394 CLIP1P30622 1438 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-215ENST00000613394 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA3Q08378 1498 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-215ENST00000613394 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS1-215ENST00000613394 EEA1Q15075 1411 aa20.11■□□□□ 0.81
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HPS1-215ENST00000613394 SMARCA2P51531 1590 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-215ENST00000613394 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HPS1-215ENST00000613394 P3H3Q8IVL6 736 aa20■□□□□ 0.79
HPS1-215ENST00000613394 CEP164Q9UPV0 1460 aa20■□□□□ 0.79
HPS1-215ENST00000613394 BCANQ96GW7 911 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-215ENST00000613394 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HPS1-215ENST00000613394 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.89■□□□□ 0.77
HPS1-215ENST00000613394 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.89■□□□□ 0.77
HPS1-215ENST00000613394 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
HPS1-215ENST00000613394 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
HPS1-215ENST00000613394 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HPS1-215ENST00000613394 MYT1Q01538 1121 aa19.78■□□□□ 0.76
HPS1-215ENST00000613394 NEFLP07196 543 aa19.76■□□□□ 0.75
HPS1-215ENST00000613394 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HPS1-215ENST00000613394 SYNJ1O43426 1573 aa19.71■□□□□ 0.75
HPS1-215ENST00000613394 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.71■□□□□ 0.75
HPS1-215ENST00000613394 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.71■□□□□ 0.75
HPS1-215ENST00000613394 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.7■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.69■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 KCNH8Q96L42 1107 aa19.67■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 TRIM52Q96A61 297 aa19.64■□□□□ 0.74
HPS1-215ENST00000613394 FKBP8Q14318 412 aa19.64■□□□□ 0.73
HPS1-215ENST00000613394 KIF27Q86VH2 1401 aa19.62■□□□□ 0.73
HPS1-215ENST00000613394 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.61■□□□□ 0.73
HPS1-215ENST00000613394 KIF21BO75037 1637 aa19.59■□□□□ 0.73
HPS1-215ENST00000613394 ARID3CA6NKF2 412 aa19.58■□□□□ 0.73
HPS1-215ENST00000613394 ANP32CO43423 234 aa19.56■□□□□ 0.72
HPS1-215ENST00000613394 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.56■□□□□ 0.72
HPS1-215ENST00000613394 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.5■□□□□ 0.71
HPS1-215ENST00000613394 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.49■□□□□ 0.71
HPS1-215ENST00000613394 CUX2O14529 1486 aa19.47■□□□□ 0.71
HPS1-215ENST00000613394 ARAP1Q96P48 1450 aa19.46■□□□□ 0.71
HPS1-215ENST00000613394 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.45■□□□□ 0.7
HPS1-215ENST00000613394 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
HPS1-215ENST00000613394 TONSLQ96HA7 1378 aa19.41■□□□□ 0.7
HPS1-215ENST00000613394 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.41■□□□□ 0.7
HPS1-215ENST00000613394 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.39■□□□□ 0.69
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