RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRM-204ENST00000577468 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRM-204ENST00000577468 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRM-204ENST00000577468 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRM-204ENST00000577468 FOXD1Q16676 465 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRM-204ENST00000577468 MSH5O43196 834 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRM-204ENST00000577468 POTEDQ86YR6 584 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRM-204ENST00000577468 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRM-204ENST00000577468 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRM-204ENST00000577468 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRM-204ENST00000577468 ADRA2BP18089 450 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRM-204ENST00000577468 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRM-204ENST00000577468 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRM-204ENST00000577468 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRM-204ENST00000577468 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRM-204ENST00000577468 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRM-204ENST00000577468 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRM-204ENST00000577468 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRM-204ENST00000577468 RNF39Q9H2S5 420 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRM-204ENST00000577468 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRM-204ENST00000577468 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-204ENST00000577468 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRM-204ENST00000577468 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
PTPRM-204ENST00000577468 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-204ENST00000577468 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN15O75808 1086 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRM-204ENST00000577468 DSG3P32926 999 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRM-204ENST00000577468 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRM-204ENST00000577468 KCNA4P22459 653 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRM-204ENST00000577468 APLP2Q06481 763 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRM-204ENST00000577468 POTEHQ6S545 545 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A2P04920 1241 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-204ENST00000577468 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-204ENST00000577468 ABCB7O75027 752 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-204ENST00000577468 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-204ENST00000577468 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-204ENST00000577468 POLA2Q14181 598 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-204ENST00000577468 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRM-204ENST00000577468 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRM-204ENST00000577468 AKT1S1Q96B36 256 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-204ENST00000577468 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRM-204ENST00000577468 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-204ENST00000577468 OSCARQ8IYS5 282 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-204ENST00000577468 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-204ENST00000577468 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-204ENST00000577468 PITPNM1O00562 1244 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRM-204ENST00000577468 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB22O15209 634 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-204ENST00000577468 HAX1O00165 279 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE6P0CI01 402 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-204ENST00000577468 FBLN2P98095 1184 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-204ENST00000577468 EVX2Q03828 476 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-204ENST00000577468 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRM-204ENST00000577468 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRR29P0C7W0 189 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-204ENST00000577468 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
PTPRM-204ENST00000577468 GABBR2O75899 941 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-204ENST00000577468 CHADLQ6NUI6 762 aa9□□□□□ -0.97
PTPRM-204ENST00000577468 LHX8Q68G74 356 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-204ENST00000577468 CLCN6P51797 869 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRM-204ENST00000577468 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-204ENST00000577468 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRM-204ENST00000577468 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-204ENST00000577468 POTEIP0CG38 1075 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-204ENST00000577468 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-204ENST00000577468 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-204ENST00000577468 CREBZFQ9NS37 354 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-204ENST00000577468 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-204ENST00000577468 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-204ENST00000577468 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-204ENST00000577468 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-204ENST00000577468 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-204ENST00000577468 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-204ENST00000577468 PHF12Q96QT6 1004 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-204ENST00000577468 OTUD5Q96G74 571 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-204ENST00000577468 POTEB2H3BUK9 544 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-204ENST00000577468 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-204ENST00000577468 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 C7P10643 843 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 PROM2Q8N271 834 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A7Q92504 469 aa8.44□□□□□ -1.06
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