RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570063.5

RSRP1-222, Transcript of arginine and serine rich protein 1, human

TSL 5

Gene RSRP1, Length 1,821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSRP1-222	ENST00000570063	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.31	■■■■□ 3.88
RSRP1-222	ENST00000570063	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RSRP1-222	ENST00000570063	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
RSRP1-222	ENST00000570063	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RSRP1-222	ENST00000570063	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RSRP1-222	ENST00000570063	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RSRP1-222	ENST00000570063	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RSRP1-222	ENST00000570063	ABCC9	O60706	1549 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RSRP1-222	ENST00000570063	NACAD	O15069	1562 aa		31.51	■■■□□ 2.63
RSRP1-222	ENST00000570063	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
RSRP1-222	ENST00000570063	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RSRP1-222	ENST00000570063	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.73	■■■□□ 2.51
RSRP1-222	ENST00000570063	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		30.59	■■■□□ 2.49
RSRP1-222	ENST00000570063	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.56	■■■□□ 2.48
RSRP1-222	ENST00000570063	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		30.45	■■■□□ 2.46
RSRP1-222	ENST00000570063	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.43	■■■□□ 2.46
RSRP1-222	ENST00000570063	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		30.27	■■■□□ 2.44
RSRP1-222	ENST00000570063	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.26	■■■□□ 2.44
RSRP1-222	ENST00000570063	WIZ	O95785	1651 aa		30.2	■■■□□ 2.43
RSRP1-222	ENST00000570063	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.1	■■■□□ 2.41
RSRP1-222	ENST00000570063	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	30.02	■■■□□ 2.4	4e-9	■■■□□ 17.7
RSRP1-222	ENST00000570063	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
RSRP1-222	ENST00000570063	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.71	■■■□□ 2.35
RSRP1-222	ENST00000570063	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
RSRP1-222	ENST00000570063	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.63	■■■□□ 2.33
RSRP1-222	ENST00000570063	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.6	■■■□□ 2.33
RSRP1-222	ENST00000570063	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.5	■■■□□ 2.31
RSRP1-222	ENST00000570063	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.48	■■■□□ 2.31
RSRP1-222	ENST00000570063	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.32	■■■□□ 2.28
RSRP1-222	ENST00000570063	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
RSRP1-222	ENST00000570063	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.17	■■■□□ 2.26
RSRP1-222	ENST00000570063	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RSRP1-222	ENST00000570063	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RSRP1-222	ENST00000570063	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RSRP1-222	ENST00000570063	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
RSRP1-222	ENST00000570063	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RSRP1-222	ENST00000570063	SOGA1	O94964	1423 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RSRP1-222	ENST00000570063	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RSRP1-222	ENST00000570063	EEA1	Q15075	1411 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RSRP1-222	ENST00000570063	CFTR	P13569	1480 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RSRP1-222	ENST00000570063	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RSRP1-222	ENST00000570063	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RSRP1-222	ENST00000570063	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.58	■■■□□ 2.16
RSRP1-222	ENST00000570063	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RSRP1-222	ENST00000570063	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.5	■■■□□ 2.15
RSRP1-222	ENST00000570063	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.48	■■■□□ 2.15
RSRP1-222	ENST00000570063	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.47	■■■□□ 2.15
RSRP1-222	ENST00000570063	CUX1	P39880	1505 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RSRP1-222	ENST00000570063	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RSRP1-222	ENST00000570063	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RSRP1-222	ENST00000570063	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.34	■■■□□ 2.13
RSRP1-222	ENST00000570063	KIF21B	O75037	1637 aa		28.33	■■■□□ 2.13
RSRP1-222	ENST00000570063	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
RSRP1-222	ENST00000570063	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RSRP1-222	ENST00000570063	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RSRP1-222	ENST00000570063	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
RSRP1-222	ENST00000570063	HRC	P23327	699 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RSRP1-222	ENST00000570063	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RSRP1-222	ENST00000570063	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RSRP1-222	ENST00000570063	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RSRP1-222	ENST00000570063	NES	P48681	1621 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RSRP1-222	ENST00000570063	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RSRP1-222	ENST00000570063	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RSRP1-222	ENST00000570063	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RSRP1-222	ENST00000570063	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RSRP1-222	ENST00000570063	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RSRP1-222	ENST00000570063	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RSRP1-222	ENST00000570063	CLIP1	P30622	1438 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RSRP1-222	ENST00000570063	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RSRP1-222	ENST00000570063	CUX2	O14529	1486 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RSRP1-222	ENST00000570063	TOPBP1	Q92547	1522 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RSRP1-222	ENST00000570063	IGF1R	P08069	1367 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RSRP1-222	ENST00000570063	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RSRP1-222	ENST00000570063	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RSRP1-222	ENST00000570063	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RSRP1-222	ENST00000570063	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RSRP1-222	ENST00000570063	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RSRP1-222	ENST00000570063	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RSRP1-222	ENST00000570063	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RSRP1-222	ENST00000570063	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RSRP1-222	ENST00000570063	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RSRP1-222	ENST00000570063	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RSRP1-222	ENST00000570063	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RSRP1-222	ENST00000570063	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.53	■■■□□ 2
RSRP1-222	ENST00000570063	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
RSRP1-222	ENST00000570063	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.49	■■□□□ 1.99
RSRP1-222	ENST00000570063	CUL7	Q14999	1698 aa		27.48	■■□□□ 1.99
RSRP1-222	ENST00000570063	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
RSRP1-222	ENST00000570063	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		27.4	■■□□□ 1.98
RSRP1-222	ENST00000570063	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
RSRP1-222	ENST00000570063	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
RSRP1-222	ENST00000570063	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.37	■■□□□ 1.97
RSRP1-222	ENST00000570063	APLP2	Q06481	763 aa		27.35	■■□□□ 1.97
RSRP1-222	ENST00000570063	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		27.28	■■□□□ 1.96
RSRP1-222	ENST00000570063	WDR62	O43379	1518 aa		27.26	■■□□□ 1.95
RSRP1-222	ENST00000570063	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.2	■■□□□ 1.95
RSRP1-222	ENST00000570063	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.2	■■□□□ 1.94
RSRP1-222	ENST00000570063	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.19	■■□□□ 1.94
RSRP1-222	ENST00000570063	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.19	■■□□□ 1.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms