RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTB-210ENST00000485459 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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RABGGTB-210ENST00000485459 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.44■□□□□ 0.38
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RABGGTB-210ENST00000485459 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.12■□□□□ 0.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 KCNA4P22459 653 aa16.79■□□□□ 0.28
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RABGGTB-210ENST00000485459 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.53■□□□□ 0.24
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RABGGTB-210ENST00000485459 SLC4A2P04920 1241 aa15.74■□□□□ 0.11
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTB-210ENST00000485459 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
RABGGTB-210ENST00000485459 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-210ENST00000485459 RASEFQ8IZ41 740 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-210ENST00000485459 NUBP1P53384 320 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM212AQ96EL1 285 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-210ENST00000485459 SPOCK2Q92563 424 aa12.87□□□□□ -0.35
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