RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485338.1

PLS1-AS1-201, PLS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PLS1-AS1, Length 346 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1-AS1-201ENST00000485338 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.75■■□□□ 1.55
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PLS1-AS1-201ENST00000485338 FOXD1Q16676 465 aa20.56■□□□□ 0.88
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.82■□□□□ 0.76
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.36■□□□□ 0.69
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ADRA2BP18089 450 aa19.29■□□□□ 0.68
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
PLS1-AS1-201ENST00000485338 MSH5O43196 834 aa19.15■□□□□ 0.66
PLS1-AS1-201ENST00000485338 POTEDQ86YR6 584 aa18.46■□□□□ 0.55
PLS1-AS1-201ENST00000485338 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PLS1-AS1-201ENST00000485338 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.52■□□□□ 0.4
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.4■□□□□ 0.38
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.04■□□□□ 0.32
PLS1-AS1-201ENST00000485338 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PLS1-AS1-201ENST00000485338 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PLS1-AS1-201ENST00000485338 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.76■□□□□ 0.27
PLS1-AS1-201ENST00000485338 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PLS1-AS1-201ENST00000485338 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PLS1-AS1-201ENST00000485338 RNF39Q9H2S5 420 aa16.38■□□□□ 0.21
PLS1-AS1-201ENST00000485338 KCNA4P22459 653 aa16.37■□□□□ 0.21
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PLS1-AS1-201ENST00000485338 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.34■□□□□ 0.21
PLS1-AS1-201ENST00000485338 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PLS1-AS1-201ENST00000485338 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
PLS1-AS1-201ENST00000485338 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SLC4A2P04920 1241 aa15.78■□□□□ 0.12
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CAPN15O75808 1086 aa15.48■□□□□ 0.07
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PLS1-AS1-201ENST00000485338 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PLS1-AS1-201ENST00000485338 DSG3P32926 999 aa15.39■□□□□ 0.05
PLS1-AS1-201ENST00000485338 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PLS1-AS1-201ENST00000485338 APLP2Q06481 763 aa15.35■□□□□ 0.05
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PLS1-AS1-201ENST00000485338 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PLS1-AS1-201ENST00000485338 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PLS1-AS1-201ENST00000485338 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.21■□□□□ 0.03
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ABCB7O75027 752 aa15.15■□□□□ 0.02
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ZBTB22O15209 634 aa15.07■□□□□ 0
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PLS1-AS1-201ENST00000485338 POLA2Q14181 598 aa14.91□□□□□ -0.02
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.73□□□□□ -0.05
PLS1-AS1-201ENST00000485338 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.5□□□□□ -0.09
PLS1-AS1-201ENST00000485338 POTEHQ6S545 545 aa14.49□□□□□ -0.09
PLS1-AS1-201ENST00000485338 OSCARQ8IYS5 282 aa14.43□□□□□ -0.1
PLS1-AS1-201ENST00000485338 AKT1S1Q96B36 256 aa14.36□□□□□ -0.11
PLS1-AS1-201ENST00000485338 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.36□□□□□ -0.11
PLS1-AS1-201ENST00000485338 FBLN2P98095 1184 aa14.31□□□□□ -0.12
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.28□□□□□ -0.12
PLS1-AS1-201ENST00000485338 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PLS1-AS1-201ENST00000485338 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.18□□□□□ -0.14
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SPDYE6P0CI01 402 aa14.18□□□□□ -0.14
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.18□□□□□ -0.14
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PITPNM1O00562 1244 aa14.08□□□□□ -0.16
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.03□□□□□ -0.16
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.99□□□□□ -0.17
PLS1-AS1-201ENST00000485338 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.18
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.85□□□□□ -0.19
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PLS1-AS1-201ENST00000485338 HAX1O00165 279 aa13.67□□□□□ -0.22
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PRR29P0C7W0 189 aa13.65□□□□□ -0.22
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PLS1-AS1-201ENST00000485338 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.64□□□□□ -0.23
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CHADLQ6NUI6 762 aa13.6□□□□□ -0.23
PLS1-AS1-201ENST00000485338 EVX2Q03828 476 aa13.56□□□□□ -0.24
PLS1-AS1-201ENST00000485338 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.48□□□□□ -0.25
PLS1-AS1-201ENST00000485338 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.48□□□□□ -0.25
PLS1-AS1-201ENST00000485338 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PROM2Q8N271 834 aa13.38□□□□□ -0.27
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CREBZFQ9NS37 354 aa13.37□□□□□ -0.27
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PLS1-AS1-201ENST00000485338 GABBR2O75899 941 aa13.24□□□□□ -0.29
PLS1-AS1-201ENST00000485338 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PLS1-AS1-201ENST00000485338 FKBP8Q14318 412 aa13.12□□□□□ -0.31
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.11□□□□□ -0.31
PLS1-AS1-201ENST00000485338 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
PLS1-AS1-201ENST00000485338 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CLCN6P51797 869 aa13.07□□□□□ -0.32
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PLS1-AS1-201ENST00000485338 POTEIP0CG38 1075 aa12.99□□□□□ -0.33
PLS1-AS1-201ENST00000485338 MIER1Q8N108 512 aa12.99□□□□□ -0.33
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PHF12Q96QT6 1004 aa12.96□□□□□ -0.33
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PLEKHG5O94827 1062 aa12.93□□□□□ -0.34
PLS1-AS1-201ENST00000485338 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PLS1-AS1-201ENST00000485338 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.9□□□□□ -0.34
PLS1-AS1-201ENST00000485338 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.88□□□□□ -0.35
PLS1-AS1-201ENST00000485338 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PLS1-AS1-201ENST00000485338 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.83□□□□□ -0.36
PLS1-AS1-201ENST00000485338 RASEFQ8IZ41 740 aa12.82□□□□□ -0.36
PLS1-AS1-201ENST00000485338 LHX8Q68G74 356 aa12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms