RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442040.5

PCBP1-AS1-232, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 1,111 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.48■■□□□ 1.35
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ADRA2BP18089 450 aa18.23■□□□□ 0.51
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 MSH5O43196 834 aa17.18■□□□□ 0.34
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.91■□□□□ 0.3
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.37■□□□□ 0.21
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.74■□□□□ 0.11
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.69■□□□□ 0.1
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.46■□□□□ 0.07
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ZBTB22O15209 634 aa15.42■□□□□ 0.06
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SLC4A2P04920 1241 aa15.34■□□□□ 0.05
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.31■□□□□ 0.04
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.023e-8■■□□□ 13.5
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 RNF39Q9H2S5 420 aa14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 APLP2Q06481 763 aa14.54□□□□□ -0.08
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CAPN15O75808 1086 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 POLA2Q14181 598 aa14.21□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ABCB7O75027 752 aa14.2□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 DSG3P32926 999 aa14.13□□□□□ -0.15
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 OSCARQ8IYS5 282 aa13.73□□□□□ -0.21
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SPDYE6P0CI01 402 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.57□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PROM2Q8N271 834 aa13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.5□□□□□ -0.25
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 FBXO3Q9UK99 471 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 AKT1S1Q96B36 256 aa13.3□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.17□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 NISCHQ9Y2I1 1504 aa13.07□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PITPNM1O00562 1244 aa13.06□□□□□ -0.32
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 MIER1Q8N108 512 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PRR29P0C7W0 189 aa13□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 KLHL34Q8N239 644 aa12.95□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PLEKHG5O94827 1062 aa12.9□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CREBZFQ9NS37 354 aa12.89□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 SPOCK2Q92563 424 aa12.85□□□□□ -0.35
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CHRDL2Q6WN34 429 aa12.82□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CHADLQ6NUI6 762 aa12.81□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
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PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 PKD2Q13563 968 aa12.69□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 NUBP1P53384 320 aa12.68□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 RASEFQ8IZ41 740 aa12.61□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.59□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 GSE1Q14687 1217 aa12.55□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 FAM212AQ96EL1 285 aa12.55□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-232ENST00000442040 RGL2O15211 777 aa12.47□□□□□ -0.41
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