RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439592.1

DMD-AS3-201, DMD antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene DMD-AS3, Length 293 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMD-AS3-201ENST00000439592 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
DMD-AS3-201ENST00000439592 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.12■■■□□ 2.41
DMD-AS3-201ENST00000439592 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
DMD-AS3-201ENST00000439592 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
DMD-AS3-201ENST00000439592 FOXD1Q16676 465 aa24.65■■□□□ 1.54
DMD-AS3-201ENST00000439592 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.27■■□□□ 1.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.56■■□□□ 1.36
DMD-AS3-201ENST00000439592 ADRA2BP18089 450 aa23.5■■□□□ 1.35
DMD-AS3-201ENST00000439592 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
DMD-AS3-201ENST00000439592 MSH5O43196 834 aa22.71■■□□□ 1.23
DMD-AS3-201ENST00000439592 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
DMD-AS3-201ENST00000439592 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.42■■□□□ 1.02
DMD-AS3-201ENST00000439592 POTEDQ86YR6 584 aa21.33■■□□□ 1.01
DMD-AS3-201ENST00000439592 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
DMD-AS3-201ENST00000439592 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.06■□□□□ 0.96
DMD-AS3-201ENST00000439592 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.82■□□□□ 0.92
DMD-AS3-201ENST00000439592 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
DMD-AS3-201ENST00000439592 KCNA4P22459 653 aa20.63■□□□□ 0.89
DMD-AS3-201ENST00000439592 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
DMD-AS3-201ENST00000439592 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
DMD-AS3-201ENST00000439592 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
DMD-AS3-201ENST00000439592 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.23■□□□□ 0.83
DMD-AS3-201ENST00000439592 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.78■□□□□ 0.76
DMD-AS3-201ENST00000439592 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
DMD-AS3-201ENST00000439592 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
DMD-AS3-201ENST00000439592 RNF39Q9H2S5 420 aa19.51■□□□□ 0.71
DMD-AS3-201ENST00000439592 SLC4A2P04920 1241 aa19.44■□□□□ 0.7
DMD-AS3-201ENST00000439592 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
DMD-AS3-201ENST00000439592 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
DMD-AS3-201ENST00000439592 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZBTB22O15209 634 aa19.02■□□□□ 0.64
DMD-AS3-201ENST00000439592 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.98■□□□□ 0.63
DMD-AS3-201ENST00000439592 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
DMD-AS3-201ENST00000439592 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
DMD-AS3-201ENST00000439592 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
DMD-AS3-201ENST00000439592 CAPN15O75808 1086 aa18.72■□□□□ 0.59
DMD-AS3-201ENST00000439592 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
DMD-AS3-201ENST00000439592 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.7■□□□□ 0.58
DMD-AS3-201ENST00000439592 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.62■□□□□ 0.57
DMD-AS3-201ENST00000439592 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
DMD-AS3-201ENST00000439592 APLP2Q06481 763 aa18.57■□□□□ 0.56
DMD-AS3-201ENST00000439592 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
DMD-AS3-201ENST00000439592 DSG3P32926 999 aa18.49■□□□□ 0.55
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
DMD-AS3-201ENST00000439592 ABCB7O75027 752 aa18.4■□□□□ 0.54
DMD-AS3-201ENST00000439592 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.28■□□□□ 0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 POLA2Q14181 598 aa18.2■□□□□ 0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
DMD-AS3-201ENST00000439592 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
DMD-AS3-201ENST00000439592 OSCARQ8IYS5 282 aa17.6■□□□□ 0.41
DMD-AS3-201ENST00000439592 FBLN2P98095 1184 aa17.59■□□□□ 0.41
DMD-AS3-201ENST00000439592 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.29■□□□□ 0.36
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPDYE6P0CI01 402 aa17.29■□□□□ 0.36
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.29■□□□□ 0.36
DMD-AS3-201ENST00000439592 AKT1S1Q96B36 256 aa17.27■□□□□ 0.36
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
DMD-AS3-201ENST00000439592 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
DMD-AS3-201ENST00000439592 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.16■□□□□ 0.34
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.06■□□□□ 0.32
DMD-AS3-201ENST00000439592 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
DMD-AS3-201ENST00000439592 PITPNM1O00562 1244 aa16.98■□□□□ 0.31
DMD-AS3-201ENST00000439592 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.98■□□□□ 0.31
DMD-AS3-201ENST00000439592 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.88■□□□□ 0.29
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
DMD-AS3-201ENST00000439592 FKBP8Q14318 412 aa16.83■□□□□ 0.28
DMD-AS3-201ENST00000439592 POTEHQ6S545 545 aa16.81■□□□□ 0.28
DMD-AS3-201ENST00000439592 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.74■□□□□ 0.27
DMD-AS3-201ENST00000439592 PROM2Q8N271 834 aa16.71■□□□□ 0.27
DMD-AS3-201ENST00000439592 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR29P0C7W0 189 aa16.64■□□□□ 0.25
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
DMD-AS3-201ENST00000439592 CHADLQ6NUI6 762 aa16.55■□□□□ 0.24
DMD-AS3-201ENST00000439592 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.55■□□□□ 0.24
DMD-AS3-201ENST00000439592 CREBZFQ9NS37 354 aa16.41■□□□□ 0.22
DMD-AS3-201ENST00000439592 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
DMD-AS3-201ENST00000439592 HAX1O00165 279 aa16.27■□□□□ 0.2
DMD-AS3-201ENST00000439592 EVX2Q03828 476 aa16.22■□□□□ 0.19
DMD-AS3-201ENST00000439592 MIER1Q8N108 512 aa16.22■□□□□ 0.19
DMD-AS3-201ENST00000439592 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
DMD-AS3-201ENST00000439592 FBXO3Q9UK99 471 aa16.18■□□□□ 0.18
DMD-AS3-201ENST00000439592 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.15■□□□□ 0.18
DMD-AS3-201ENST00000439592 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.14■□□□□ 0.17
DMD-AS3-201ENST00000439592 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
DMD-AS3-201ENST00000439592 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
DMD-AS3-201ENST00000439592 PLEKHG5O94827 1062 aa16.03■□□□□ 0.16
DMD-AS3-201ENST00000439592 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
DMD-AS3-201ENST00000439592 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.92■□□□□ 0.14
DMD-AS3-201ENST00000439592 RASEFQ8IZ41 740 aa15.88■□□□□ 0.13
DMD-AS3-201ENST00000439592 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
DMD-AS3-201ENST00000439592 KLHL34Q8N239 644 aa15.87■□□□□ 0.13
DMD-AS3-201ENST00000439592 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
DMD-AS3-201ENST00000439592 NUBP1P53384 320 aa15.85■□□□□ 0.13
DMD-AS3-201ENST00000439592 GABBR2O75899 941 aa15.8■□□□□ 0.12
DMD-AS3-201ENST00000439592 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
DMD-AS3-201ENST00000439592 PHF12Q96QT6 1004 aa15.79■□□□□ 0.12
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms