RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.38■■■■□ 3.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.85■■■■□ 3.01
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.3■■■□□ 2.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.24■■■□□ 2.91
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC9O60706 1549 aa32.51■■■□□ 2.79
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.12■■■□□ 2.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SCRIBQ14160 1630 aa31.84■■■□□ 2.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NACADO15069 1562 aa31.52■■■□□ 2.64
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.5■■■□□ 2.63
SH3BP1-202ENST00000417536 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.39■■■□□ 2.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP1-202ENST00000417536 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
SH3BP1-202ENST00000417536 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.94■■■□□ 2.54
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.93■■■□□ 2.54
SH3BP1-202ENST00000417536 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
SH3BP1-202ENST00000417536 HRCP23327 699 aa30.73■■■□□ 2.51
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP1-202ENST00000417536 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.67■■■□□ 2.5
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.53■■■□□ 2.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.53■■■□□ 2.48
SH3BP1-202ENST00000417536 WIZO95785 1651 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BP1-202ENST00000417536 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCA4P51532 1647 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM41Q8WV44 630 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCA2P51531 1590 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP1-202ENST00000417536 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.71■■■□□ 2.35
SH3BP1-202ENST00000417536 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
SH3BP1-202ENST00000417536 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC8Q09428 1581 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAPD3P42695 1498 aa29.19■■■□□ 2.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.16■■■□□ 2.26
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGXB3Q12766 1538 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SOGA1O94964 1423 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP1-202ENST00000417536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.231e-323■■■■■ 56.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNJ1O43426 1573 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.95■■■□□ 2.23
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CFTRP13569 1480 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP162Q5TB80 1403 aa28.7■■■□□ 2.18
SH3BP1-202ENST00000417536 NESP48681 1621 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP1-202ENST00000417536 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP1-202ENST00000417536 CUX1P39880 1505 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP1-202ENST00000417536 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP1-202ENST00000417536 TOP2BQ02880 1626 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP1-202ENST00000417536 EEA1Q15075 1411 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP1-202ENST00000417536 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM2Q13029 1718 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA3Q08378 1498 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.33■■■□□ 2.12
SH3BP1-202ENST00000417536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.26■■■□□ 2.12
SH3BP1-202ENST00000417536 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP1-202ENST00000417536 CUX2O14529 1486 aa28.2■■■□□ 2.11
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF21BO75037 1637 aa28.17■■■□□ 2.1
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF27Q86VH2 1401 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP1-202ENST00000417536 CLIP1P30622 1438 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP1-202ENST00000417536 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SH3BP1-202ENST00000417536 TOPBP1Q92547 1522 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP1-202ENST00000417536 NEUROD1Q13562 356 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP1-202ENST00000417536 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SH3BP1-202ENST00000417536 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SH3BP1-202ENST00000417536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP1-202ENST00000417536 PRXQ9BXM0 1461 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 IGF1RP08069 1367 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 APLP2Q06481 763 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP1-202ENST00000417536 P3H3Q8IVL6 736 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ERCC6Q03468 1493 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP1-202ENST00000417536 ARAP1Q96P48 1450 aa27.69■■■□□ 2.02
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