RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.231e-323■■■■■ 56.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.63e-59■■■■■ 48
SH3BP1-202ENST00000417536 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.71e-33■■■■■ 119.7
SH3BP1-202ENST00000417536 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.967e-30■■□□□ 14.1
SH3BP1-202ENST00000417536 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.723e-19■■■■□ 21.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.773e-16■■■■■ 31.7
SH3BP1-202ENST00000417536 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.032e-15■■■□□ 14.9
SH3BP1-202ENST00000417536 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.92e-14■■■□□ 17.3
SH3BP1-202ENST00000417536 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.825e-14■■■■■ 132.3
SH3BP1-202ENST00000417536 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.94e-13■■■■■ 47.6
SH3BP1-202ENST00000417536 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.456e-13■■■■■ 31.9
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 35.8
SH3BP1-202ENST00000417536 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 28.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.781e-10■■■■□ 25.6
SH3BP1-202ENST00000417536 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 48.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.862e-10■■■■□ 26.4
SH3BP1-202ENST00000417536 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 34.7
SH3BP1-202ENST00000417536 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 34.7
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.759e-9■■■■□ 19.6
SH3BP1-202ENST00000417536 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.991e-8■■■■■ 56
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.052e-7■■■□□ 14.6
SH3BP1-202ENST00000417536 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.73e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.084e-7■■■■□ 25.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 29
SH3BP1-202ENST00000417536 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 34.6
SH3BP1-202ENST00000417536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 30.4
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 29.7
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 137.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 17.4
SH3BP1-202ENST00000417536 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.424e-6■■■■□ 20.8
SH3BP1-202ENST00000417536 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 19.1
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.775e-6■■□□□ 11.5
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