RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

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Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
RPS3AP25-201ENST00000411660 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.08■■■□□ 2.41
RPS3AP25-201ENST00000411660 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RPS3AP25-201ENST00000411660 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RPS3AP25-201ENST00000411660 FOXD1Q16676 465 aa24.57■■□□□ 1.52
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.26■■□□□ 1.47
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.42■■□□□ 1.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADRA2BP18089 450 aa23.35■■□□□ 1.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP25-201ENST00000411660 MSH5O43196 834 aa22.74■■□□□ 1.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RPS3AP25-201ENST00000411660 POTEDQ86YR6 584 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP25-201ENST00000411660 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.05■□□□□ 0.96
RPS3AP25-201ENST00000411660 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCNA4P22459 653 aa20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RPS3AP25-201ENST00000411660 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP25-201ENST00000411660 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF39Q9H2S5 420 aa19.49■□□□□ 0.71
RPS3AP25-201ENST00000411660 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC4A2P04920 1241 aa19.37■□□□□ 0.69
RPS3AP25-201ENST00000411660 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
RPS3AP25-201ENST00000411660 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
RPS3AP25-201ENST00000411660 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
RPS3AP25-201ENST00000411660 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.95■□□□□ 0.62
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZBTB22O15209 634 aa18.87■□□□□ 0.61
RPS3AP25-201ENST00000411660 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
RPS3AP25-201ENST00000411660 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
RPS3AP25-201ENST00000411660 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
RPS3AP25-201ENST00000411660 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
RPS3AP25-201ENST00000411660 APLP2Q06481 763 aa18.65■□□□□ 0.58
RPS3AP25-201ENST00000411660 CAPN15O75808 1086 aa18.61■□□□□ 0.57
RPS3AP25-201ENST00000411660 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.53■□□□□ 0.56
RPS3AP25-201ENST00000411660 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.48■□□□□ 0.55
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP25-201ENST00000411660 DSG3P32926 999 aa18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.35■□□□□ 0.53
RPS3AP25-201ENST00000411660 ABCB7O75027 752 aa18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP25-201ENST00000411660 POLA2Q14181 598 aa18.11■□□□□ 0.49
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP25-201ENST00000411660 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP25-201ENST00000411660 FBLN2P98095 1184 aa17.57■□□□□ 0.4
RPS3AP25-201ENST00000411660 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
RPS3AP25-201ENST00000411660 OSCARQ8IYS5 282 aa17.49■□□□□ 0.39
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPDYE6P0CI01 402 aa17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 AKT1S1Q96B36 256 aa17.29■□□□□ 0.36
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP25-201ENST00000411660 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP25-201ENST00000411660 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.93■□□□□ 0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 PITPNM1O00562 1244 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RPS3AP25-201ENST00000411660 POTEHQ6S545 545 aa16.75■□□□□ 0.27
RPS3AP25-201ENST00000411660 PROM2Q8N271 834 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.74■□□□□ 0.27
RPS3AP25-201ENST00000411660 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 FKBP8Q14318 412 aa16.7■□□□□ 0.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.67■□□□□ 0.26
RPS3AP25-201ENST00000411660 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.6■□□□□ 0.25
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRR29P0C7W0 189 aa16.58■□□□□ 0.24
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP25-201ENST00000411660 CHADLQ6NUI6 762 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS3AP25-201ENST00000411660 CREBZFQ9NS37 354 aa16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP25-201ENST00000411660 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP25-201ENST00000411660 FBXO3Q9UK99 471 aa16.2■□□□□ 0.18
RPS3AP25-201ENST00000411660 HAX1O00165 279 aa16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP25-201ENST00000411660 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP25-201ENST00000411660 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP25-201ENST00000411660 MIER1Q8N108 512 aa16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP25-201ENST00000411660 EVX2Q03828 476 aa16.09■□□□□ 0.17
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLEKHG5O94827 1062 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP25-201ENST00000411660 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
RPS3AP25-201ENST00000411660 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP25-201ENST00000411660 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP25-201ENST00000411660 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.83■□□□□ 0.12
RPS3AP25-201ENST00000411660 NUBP1P53384 320 aa15.81■□□□□ 0.12
RPS3AP25-201ENST00000411660 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP25-201ENST00000411660 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP25-201ENST00000411660 RASEFQ8IZ41 740 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP25-201ENST00000411660 KLHL34Q8N239 644 aa15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP25-201ENST00000411660 GABBR2O75899 941 aa15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLCN6P51797 869 aa15.71■□□□□ 0.11
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