RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.85■■■□□ 2.05
ZBED1-202ENST00000381222 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.14■■□□□ 1.93
ZBED1-202ENST00000381222 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.15■■□□□ 1.78
ZBED1-202ENST00000381222 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ZBED1-202ENST00000381222 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.01■■□□□ 1.59
ZBED1-202ENST00000381222 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ZBED1-202ENST00000381222 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ZBED1-202ENST00000381222 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED1-202ENST00000381222 TRIM41Q8WV44 630 aa23.85■■□□□ 1.41
ZBED1-202ENST00000381222 ABCC9O60706 1549 aa23.79■■□□□ 1.4
ZBED1-202ENST00000381222 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ZBED1-202ENST00000381222 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.7■■□□□ 1.38
ZBED1-202ENST00000381222 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED1-202ENST00000381222 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ZBED1-202ENST00000381222 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
ZBED1-202ENST00000381222 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ZBED1-202ENST00000381222 APLP2Q06481 763 aa23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-202ENST00000381222 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-202ENST00000381222 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-202ENST00000381222 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-202ENST00000381222 SCRIBQ14160 1630 aa22.91■■□□□ 1.26
ZBED1-202ENST00000381222 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.75■■□□□ 1.23
ZBED1-202ENST00000381222 HRCP23327 699 aa22.67■■□□□ 1.22
ZBED1-202ENST00000381222 ITGAEP38570 1179 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1-202ENST00000381222 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ZBED1-202ENST00000381222 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ZBED1-202ENST00000381222 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.46■■□□□ 1.19
ZBED1-202ENST00000381222 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ZBED1-202ENST00000381222 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ZBED1-202ENST00000381222 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ZBED1-202ENST00000381222 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1-202ENST00000381222 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.21■■□□□ 1.15
ZBED1-202ENST00000381222 P3H3Q8IVL6 736 aa22.17■■□□□ 1.14
ZBED1-202ENST00000381222 ARID3CA6NKF2 412 aa22.05■■□□□ 1.12
ZBED1-202ENST00000381222 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
ZBED1-202ENST00000381222 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ZBED1-202ENST00000381222 FBLN2P98095 1184 aa21.92■■□□□ 1.1
ZBED1-202ENST00000381222 NACADO15069 1562 aa21.92■■□□□ 1.1
ZBED1-202ENST00000381222 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ZBED1-202ENST00000381222 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.88■■□□□ 1.09
ZBED1-202ENST00000381222 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ZBED1-202ENST00000381222 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.84■■□□□ 1.09
ZBED1-202ENST00000381222 NEUROD1Q13562 356 aa21.79■■□□□ 1.08
ZBED1-202ENST00000381222 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ZBED1-202ENST00000381222 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.74■■□□□ 1.07
ZBED1-202ENST00000381222 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.67■■□□□ 1.06
ZBED1-202ENST00000381222 SOGA1O94964 1423 aa21.6■■□□□ 1.05
ZBED1-202ENST00000381222 TRIM52Q96A61 297 aa21.59■■□□□ 1.05
ZBED1-202ENST00000381222 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ZBED1-202ENST00000381222 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ZBED1-202ENST00000381222 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
ZBED1-202ENST00000381222 ABCC8Q09428 1581 aa21.55■■□□□ 1.04
ZBED1-202ENST00000381222 WIZO95785 1651 aa21.55■■□□□ 1.04
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED1-202ENST00000381222 CEP162Q5TB80 1403 aa21.48■■□□□ 1.03
ZBED1-202ENST00000381222 CLIP1P30622 1438 aa21.45■■□□□ 1.02
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ZBED1-202ENST00000381222 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ZBED1-202ENST00000381222 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.36■■□□□ 1.01
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ZBED1-202ENST00000381222 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
ZBED1-202ENST00000381222 GOLGA3Q08378 1498 aa21.26■□□□□ 0.99
ZBED1-202ENST00000381222 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.24■□□□□ 0.99
ZBED1-202ENST00000381222 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.23■□□□□ 0.99
ZBED1-202ENST00000381222 NEFLP07196 543 aa21.21■□□□□ 0.99
ZBED1-202ENST00000381222 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.21■□□□□ 0.99
ZBED1-202ENST00000381222 KIF27Q86VH2 1401 aa21.13■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 BCANQ96GW7 911 aa21.12■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 EEA1Q15075 1411 aa21.12■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.09■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.09■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.08■□□□□ 0.97
ZBED1-202ENST00000381222 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
ZBED1-202ENST00000381222 CUX2O14529 1486 aa21.07■□□□□ 0.96
ZBED1-202ENST00000381222 SMARCA4P51532 1647 aa21.06■□□□□ 0.96
ZBED1-202ENST00000381222 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ZBED1-202ENST00000381222 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.06■□□□□ 0.96
ZBED1-202ENST00000381222 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ZBED1-202ENST00000381222 MIER1Q8N108 512 aa21.01■□□□□ 0.95
ZBED1-202ENST00000381222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
ZBED1-202ENST00000381222 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.98■□□□□ 0.95
ZBED1-202ENST00000381222 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED1-202ENST00000381222 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED1-202ENST00000381222 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZBED1-202ENST00000381222 SMARCA2P51531 1590 aa20.93■□□□□ 0.94
ZBED1-202ENST00000381222 ANP32CO43423 234 aa20.92■□□□□ 0.94
ZBED1-202ENST00000381222 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.943e-6■■■□□ 15.4
ZBED1-202ENST00000381222 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.91■□□□□ 0.94
ZBED1-202ENST00000381222 KCNH8Q96L42 1107 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED1-202ENST00000381222 TONSLQ96HA7 1378 aa20.89■□□□□ 0.93
ZBED1-202ENST00000381222 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ZBED1-202ENST00000381222 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.85■□□□□ 0.93
ZBED1-202ENST00000381222 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.83■□□□□ 0.92
ZBED1-202ENST00000381222 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.82■□□□□ 0.92
ZBED1-202ENST00000381222 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.79■□□□□ 0.92
ZBED1-202ENST00000381222 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.5 ms