RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 137.9
SH3BP1-201ENST00000357436 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.845e-14■■■■■ 132.3
SH3BP1-201ENST00000357436 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.691e-33■■■■■ 119.7
SH3BP1-201ENST00000357436 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.321e-323■■■■■ 56.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.981e-8■■■■■ 56
SH3BP1-201ENST00000357436 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 48.2
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.623e-59■■■■■ 48
SH3BP1-201ENST00000357436 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.884e-13■■■■■ 47.6
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.863e-11■■■■■ 35.8
SH3BP1-201ENST00000357436 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 34.7
SH3BP1-201ENST00000357436 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 34.7
SH3BP1-201ENST00000357436 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 34.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.476e-13■■■■■ 31.9
SH3BP1-201ENST00000357436 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.783e-16■■■■■ 31.7
SH3BP1-201ENST00000357436 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.082e-6■■■■■ 30.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 29.7
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 29
SH3BP1-201ENST00000357436 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.851e-10■■■■■ 28.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.892e-10■■■■□ 26.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 25.8
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.771e-10■■■■□ 25.6
SH3BP1-201ENST00000357436 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.793e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-201ENST00000357436 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.713e-19■■■■□ 21.9
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.484e-6■■■■□ 20.8
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.789e-9■■■■□ 19.6
SH3BP1-201ENST00000357436 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 19.1
SH3BP1-201ENST00000357436 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.543e-6■■■□□ 17.4
SH3BP1-201ENST00000357436 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.932e-14■■■□□ 17.3
SH3BP1-201ENST00000357436 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.052e-15■■■□□ 14.9
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.092e-7■■■□□ 14.6
SH3BP1-201ENST00000357436 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.27■■□□□ 17e-30■■□□□ 14.1
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.845e-6■■□□□ 11.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.8
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