RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SMARCA2P51531 1590 aa17.02■□□□□ 0.31
RABGGTB-201ENST00000319942 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEIP0CG38 1075 aa16.99■□□□□ 0.31
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RABGGTB-201ENST00000319942 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 NCAPD3P42695 1498 aa16.93■□□□□ 0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.92■□□□□ 0.3
RABGGTB-201ENST00000319942 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM41Q8WV44 630 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGXB3Q12766 1538 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGGTB-201ENST00000319942 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTB-201ENST00000319942 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.65■□□□□ 0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 CREBZFQ9NS37 354 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTB-201ENST00000319942 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 CFTRP13569 1480 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 OTUD5Q96G74 571 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC8Q09428 1581 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEB2H3BUK9 544 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF12Q96QT6 1004 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEMA6NI47 508 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 EEA1Q15075 1411 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SOGA1O94964 1423 aa16.27■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNJ1O43426 1573 aa16.27■□□□□ 0.2
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEGQ6S5H5 508 aa16.27■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 NESP48681 1621 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 TOP2BQ02880 1626 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 CUX1P39880 1505 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A7Q92504 469 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 METRNQ9UJH8 293 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGGTB-201ENST00000319942 C7P10643 843 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM2Q13029 1718 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTB-201ENST00000319942 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF27Q86VH2 1401 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTB-201ENST00000319942 TOPBP1Q92547 1522 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEJP0CG39 1038 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA3Q08378 1498 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CUX2O14529 1486 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTB-201ENST00000319942 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 IGF1RP08069 1367 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ERCC6Q03468 1493 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.96■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 PRXQ9BXM0 1461 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF21BO75037 1637 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF12Q96FN5 646 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP162Q5TB80 1403 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 PROM2Q8N271 834 aa15.84■□□□□ 0.13
RABGGTB-201ENST00000319942 TIE1P35590 1138 aa15.83■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.83■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR62O43379 1518 aa15.82■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT140Q96RY7 1462 aa15.82■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIP1P30622 1438 aa15.82■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEFA5A3E0 1075 aa15.81■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG5O94827 1062 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPC6Q9Y210 931 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms