RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000177056.7

Taf6l-211, Transcript of TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Taf6l, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa34.5■■■■□ 3.11
Taf6l-211ENSMUST00000177056 NischQ80TM9 1593 aa34.32■■■■□ 3.09
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Abcc9P70170 1546 aa33.2■■■□□ 2.9
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Abcc8B2RUS7 1588 aa33.03■■■□□ 2.88
Taf6l-211ENSMUST00000177056 ScribQ80U72 1612 aa31.7■■■□□ 2.66
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Rtl1Q7M732 1744 aa31.33■■■□□ 2.61
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.27■■■□□ 2.6
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Kdm5dQ62240 1548 aa30.74■■■□□ 2.51
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ccdc180J3QNE4 1664 aa30.7■■■□□ 2.51
Taf6l-211ENSMUST00000177056 NacadQ5SWP3 1504 aa30.68■■■□□ 2.5
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Dcaf1Q80TR8 1506 aa30.36■■■□□ 2.45
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Sycp2Q9CUU3 1500 aa30.06■■■□□ 2.4
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.98■■■□□ 2.39
Taf6l-211ENSMUST00000177056 BicraF8VPZ9 1578 aa29.64■■■□□ 2.34
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Baz1aO88379 1555 aa29.52■■■□□ 2.32
Taf6l-211ENSMUST00000177056 HrcG5E8J6 738 aa29.21■■■□□ 2.27
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Crybg2B7ZCC2 1516 aa29.2■■■□□ 2.27
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29.17■■■□□ 2.26
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.96■■■□□ 2.23
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Smarca2Q6DIC0 1577 aa28.75■■■□□ 2.19
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Trim41Q5NCC3 630 aa28.57■■■□□ 2.16
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa28.54■■■□□ 2.16
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28.45■■■□□ 2.14
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cep164Q5DU05 1446 aa28.3■■■□□ 2.12
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa28.25■■■□□ 2.11
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.15■■■□□ 2.1
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa27.98■■■□□ 2.07
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.93■■■□□ 2.06
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Wdr62Q3U3T8 1523 aa27.92■■■□□ 2.06
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Frmpd1A2AKB4 1549 aa27.91■■■□□ 2.06
Taf6l-211ENSMUST00000177056 CftrP26361 1476 aa27.88■■■□□ 2.05
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.85■■■□□ 2.05
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Golga3P55937 1487 aa27.79■■■□□ 2.04
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Fam135aQ6NS59 1506 aa27.73■■■□□ 2.03
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cngb1E1AZ71 1325 aa27.72■■■□□ 2.03
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Chic1Q8CBW7 227 aa27.65■■■□□ 2.02
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Unc13aQ4KUS2 1712 aa27.62■■■□□ 2.01
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.57■■■□□ 2
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ubl4bQ9CQ84 188 aa27.48■■□□□ 1.99
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Top2bQ64511 1612 aa27.48■■□□□ 1.99
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Gab3Q8BSM5 595 aa27.36■■□□□ 1.97
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Pcgf6Q99NA9 353 aa27.28■■□□□ 1.96
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.21■■□□□ 1.95
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Mrc2Q64449 1479 aa27.14■■□□□ 1.93
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Kif15Q6P9L6 1387 aa27.09■■□□□ 1.93
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Fmn1Q05860 1466 aa27.07■■□□□ 1.92
Taf6l-211ENSMUST00000177056 NefmP08553 848 aa26.99■■□□□ 1.91
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.98■■□□□ 1.91
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cux2P70298 1426 aa26.97■■□□□ 1.91
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Lamc3Q9R0B6 1581 aa26.96■■□□□ 1.91
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Mier1Q5UAK0 511 aa26.84■■□□□ 1.89
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Taf6l-211ENSMUST00000177056 TnnQ80Z71 1560 aa26.76■■□□□ 1.87
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Il27Q8K3I6 234 aa26.75■■□□□ 1.87
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Kif21aQ9QXL2 1672 aa26.72■■□□□ 1.87
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.71■■□□□ 1.87
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ccdc18Q640L5 1455 aa26.61■■□□□ 1.85
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa26.59■■□□□ 1.85
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Camsap1A2AHC3 1581 aa26.57■■□□□ 1.84
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Zeb1Q64318 1117 aa26.51■■□□□ 1.83
Taf6l-211ENSMUST00000177056 UbtfP25976 765 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
Taf6l-211ENSMUST00000177056 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Npm2Q80W85 207 aa26.41■■□□□ 1.82
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Myt1lP97500 1187 aa26.39■■□□□ 1.81
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Crocc2F6XLV1 1638 aa26.31■■□□□ 1.8
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Clip1Q922J3 1391 aa26.3■■□□□ 1.8
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Plb1Q3TTY0 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Taf6l-211ENSMUST00000177056 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
Taf6l-211ENSMUST00000177056 NrkQ9R0G8 1455 aa26.27■■□□□ 1.8
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Grin2bQ01097 1482 aa26.24■■□□□ 1.79
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Arhgap35Q91YM2 1499 aa26.23■■□□□ 1.79
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Sall2Q9QX96 1004 aa26.2■■□□□ 1.78
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Duox2A2AQ99 1517 aa26.19■■□□□ 1.78
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Taf6l-211ENSMUST00000177056 PtprkP35822 1457 aa26.12■■□□□ 1.77
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Map3k1P53349 1493 aa26.11■■□□□ 1.77
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Shroom4Q1W617 1475 aa26.1■■□□□ 1.77
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Eea1Q8BL66 1411 aa26.08■■□□□ 1.77
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa26.08■■□□□ 1.77
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Neurod1Q60867 357 aa26.07■■□□□ 1.76
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Samd9lQ69Z37 1561 aa26.03■■□□□ 1.76
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa26.02■■□□□ 1.76
Taf6l-211ENSMUST00000177056 Ift140E9PY46 1464 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.1 ms