RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176667.7

Lrch4-204, Transcript of Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrch4, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch4-204ENSMUST00000176667 NischQ80TM9 1593 aa36.97■■■■□ 3.51
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa36.9■■■■□ 3.5
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Abcc9P70170 1546 aa35.85■■■■□ 3.33
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Abcc8B2RUS7 1588 aa35.41■■■■□ 3.26
Lrch4-204ENSMUST00000176667 ScribQ80U72 1612 aa33.55■■■□□ 2.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rhox8Q6VSS7 320 aa33.09■■■□□ 2.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.86■■■□□ 2.85
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kdm5dQ62240 1548 aa32.71■■■□□ 2.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 NacadQ5SWP3 1504 aa32.64■■■□□ 2.82
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa32.31■■■□□ 2.76
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Sycp2Q9CUU3 1500 aa31.94■■■□□ 2.7
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.93■■■□□ 2.7
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Baz1aO88379 1555 aa31.91■■■□□ 2.7
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rtl1Q7M732 1744 aa31.63■■■□□ 2.65
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.57■■■□□ 2.64
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
Lrch4-204ENSMUST00000176667 BicraF8VPZ9 1578 aa31.33■■■□□ 2.61
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Smarca2Q6DIC0 1577 aa31.08■■■□□ 2.57
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.79■■■□□ 2.52
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa30.59■■■□□ 2.49
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Trim41Q5NCC3 630 aa30.31■■■□□ 2.44
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Synj1Q8CHC4 1574 aa30.12■■■□□ 2.41
Lrch4-204ENSMUST00000176667 CftrP26361 1476 aa30.08■■■□□ 2.41
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa30.05■■■□□ 2.4
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa30■■■□□ 2.39
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ercc6F8VPZ5 1481 aa29.7■■■□□ 2.34
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Wdr62Q3U3T8 1523 aa29.61■■■□□ 2.33
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Golga3P55937 1487 aa29.6■■■□□ 2.33
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cngb1E1AZ71 1325 aa29.58■■■□□ 2.33
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Frmpd1A2AKB4 1549 aa29.58■■■□□ 2.33
Lrch4-204ENSMUST00000176667 HrcG5E8J6 738 aa29.5■■■□□ 2.31
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Top2bQ64511 1612 aa29.39■■■□□ 2.3
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa29.22■■■□□ 2.27
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Unc13aQ4KUS2 1712 aa29.17■■■□□ 2.26
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fam135aQ6NS59 1506 aa29.13■■■□□ 2.25
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa29.1■■■□□ 2.25
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fmn1Q05860 1466 aa29.05■■■□□ 2.24
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa29.05■■■□□ 2.24
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Chic1Q8CBW7 227 aa29.04■■■□□ 2.24
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cep164Q5DU05 1446 aa29.04■■■□□ 2.24
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.94■■■□□ 2.22
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28.93■■■□□ 2.22
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.93■■■□□ 2.22
Lrch4-204ENSMUST00000176667 TnnQ80Z71 1560 aa28.9■■■□□ 2.22
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Baz1bQ9Z277 1479 aa28.75■■■□□ 2.19
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cux2P70298 1426 aa28.66■■■□□ 2.18
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gab3Q8BSM5 595 aa28.59■■■□□ 2.17
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ccdc18Q640L5 1455 aa28.57■■■□□ 2.16
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Camsap1A2AHC3 1581 aa28.56■■■□□ 2.16
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Il27Q8K3I6 234 aa28.55■■■□□ 2.16
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mrc2Q64449 1479 aa28.51■■■□□ 2.15
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Grin2bQ01097 1482 aa28.28■■■□□ 2.12
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.26■■■□□ 2.12
Lrch4-204ENSMUST00000176667 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Lrch4-204ENSMUST00000176667 NrkQ9R0G8 1455 aa28.21■■■□□ 2.11
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Npm2Q80W85 207 aa28.19■■■□□ 2.1
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kif21aQ9QXL2 1672 aa28.17■■■□□ 2.1
Lrch4-204ENSMUST00000176667 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Lrch4-204ENSMUST00000176667 PtprkP35822 1457 aa28.14■■■□□ 2.1
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Shroom4Q1W617 1475 aa28.14■■■□□ 2.1
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cep162Q6ZQ06 1403 aa28.06■■■□□ 2.08
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Duox2A2AQ99 1517 aa28.06■■■□□ 2.08
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Efcab5A0JP43 1406 aa28.03■■■□□ 2.08
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.98■■■□□ 2.07
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.9■■■□□ 2.06
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Myt1lP97500 1187 aa27.9■■■□□ 2.06
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Zeb1Q64318 1117 aa27.89■■■□□ 2.06
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.85■■■□□ 2.05
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Plb1Q3TTY0 1478 aa27.83■■■□□ 2.05
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa27.81■■■□□ 2.04
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Map3k1P53349 1493 aa27.81■■■□□ 2.04
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa27.8■■■□□ 2.04
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Lrch4-204ENSMUST00000176667 SynmQ70IV5 1561 aa27.68■■■□□ 2.02
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rad54l2Q99NG0 1466 aa27.67■■■□□ 2.02
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Clip1Q922J3 1391 aa27.65■■■□□ 2.02
Lrch4-204ENSMUST00000176667 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ift140E9PY46 1464 aa27.62■■■□□ 2.01
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Carmil1Q6EDY6 1374 aa27.58■■■□□ 2.01
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Disp1Q3TDN0 1521 aa27.58■■■□□ 2.01
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Magi3Q9EQJ9 1476 aa27.52■■■□□ 2
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Grin2aP35436 1464 aa27.51■■□□□ 1.99
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Pla2r1Q62028 1487 aa27.48■■□□□ 1.99
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Eea1Q8BL66 1411 aa27.43■■□□□ 1.98
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.6 ms