RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 NischQ80TM9 1593 aa42.56■■■■■ 4.4
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa42.28■■■■■ 4.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc9P70170 1546 aa41.2■■■■■ 4.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc8B2RUS7 1588 aa40.72■■■■■ 4.11
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rhox8Q6VSS7 320 aa40.17■■■■■ 4.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rtl1Q7M732 1744 aa39.78■■■■□ 3.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39.26■■■■□ 3.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 ScribQ80U72 1612 aa38.76■■■■□ 3.8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa38.53■■■■□ 3.76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm5dQ62240 1548 aa37.7■■■■□ 3.63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
Nisch-222ENSMUST00000172142 HrcG5E8J6 738 aa37.44■■■■□ 3.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.42■■■■□ 3.58
Nisch-222ENSMUST00000172142 NacadQ5SWP3 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37.24■■■■□ 3.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa37.13■■■■□ 3.54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sycp2Q9CUU3 1500 aa36.65■■■■□ 3.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Baz1aO88379 1555 aa36.64■■■■□ 3.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trim41Q5NCC3 630 aa36.6■■■■□ 3.45
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pcgf6Q99NA9 353 aa36.42■■■■□ 3.42
Nisch-222ENSMUST00000172142 BicraF8VPZ9 1578 aa36.16■■■■□ 3.38
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cep164Q5DU05 1446 aa36.07■■■■□ 3.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.92■■■■□ 3.34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.83■■■■□ 3.33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cngb1E1AZ71 1325 aa35.49■■■■□ 3.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa35.45■■■■□ 3.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gab3Q8BSM5 595 aa35.4■■■■□ 3.26
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chic1Q8CBW7 227 aa35.37■■■■□ 3.25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 NefmP08553 848 aa35.18■■■■□ 3.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zeb1Q64318 1117 aa35.14■■■■□ 3.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35■■■■□ 3.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mier1Q5UAK0 511 aa35■■■■□ 3.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Golga3P55937 1487 aa34.99■■■■□ 3.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Neurod1Q60867 357 aa34.96■■■■□ 3.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.82■■■■□ 3.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sall2Q9QX96 1004 aa34.62■■■■□ 3.13
Nisch-222ENSMUST00000172142 CftrP26361 1476 aa34.61■■■■□ 3.13
Nisch-222ENSMUST00000172142 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa34.55■■■■□ 3.12
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
Nisch-222ENSMUST00000172142 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.45■■■■□ 3.1
Nisch-222ENSMUST00000172142 UbtfP25976 765 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
Nisch-222ENSMUST00000172142 Top2bQ64511 1612 aa34.35■■■■□ 3.09
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr66E9Q743 1299 aa34.22■■■■□ 3.07
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anks4bQ8K3X6 423 aa34.16■■■■□ 3.06
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa34.11■■■■□ 3.05
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34.06■■■■□ 3.04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Frmpd1A2AKB4 1549 aa34.05■■■■□ 3.04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr62Q3U3T8 1523 aa34■■■■□ 3.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Myt1lP97500 1187 aa33.99■■■■□ 3.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33.96■■■■□ 3.03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 ClspnQ80YR7 1315 aa33.93■■■■□ 3.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fmn1Q05860 1466 aa33.93■■■■□ 3.02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33.87■■■■□ 3.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa33.87■■■■□ 3.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Unc13aQ4KUS2 1712 aa33.82■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Csrnp3P59055 597 aa33.82■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa33.78■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Npm2Q80W85 207 aa33.77■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 TonslQ6NZL6 1363 aa33.75■■■□□ 2.99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa33.65■■■□□ 2.98
Nisch-222ENSMUST00000172142 Clip1Q922J3 1391 aa33.61■■■□□ 2.97
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33.55■■■□□ 2.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aplp2Q06335 707 aa33.41■■■□□ 2.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa33.34■■■□□ 2.93
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam135aQ6NS59 1506 aa33.33■■■□□ 2.93
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif15Q6P9L6 1387 aa33.32■■■□□ 2.92
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ubl4bQ9CQ84 188 aa33.31■■■□□ 2.92
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
Nisch-222ENSMUST00000172142 CenpbP27790 599 aa33.23■■■□□ 2.91
Nisch-222ENSMUST00000172142 Il27Q8K3I6 234 aa33.2■■■□□ 2.91
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33.2■■■□□ 2.9
Nisch-222ENSMUST00000172142 TnnQ80Z71 1560 aa33.19■■■□□ 2.9
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eea1Q8BL66 1411 aa33.08■■■□□ 2.89
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgap35Q91YM2 1499 aa33.07■■■□□ 2.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa33.02■■■□□ 2.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eid3Q3V124 375 aa32.99■■■□□ 2.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cux2P70298 1426 aa32.99■■■□□ 2.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Myt1Q8CFC2 1127 aa32.97■■■□□ 2.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arap1Q4LDD4 1452 aa32.96■■■□□ 2.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Setd5Q5XJV7 1441 aa32.92■■■□□ 2.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm38655A0A286YDK6 273 aa32.91■■■□□ 2.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 PtprkP35822 1457 aa32.9■■■□□ 2.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 NrkQ9R0G8 1455 aa32.9■■■□□ 2.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.89■■■□□ 2.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.88■■■□□ 2.85
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