RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113312.8

Shq1-202, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 6,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rhox8Q6VSS7 320 aa29.52■■■□□ 2.32
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ube2uB1AUC4 352 aa26.66■■□□□ 1.86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Wdr66E9Q743 1299 aa26.37■■□□□ 1.81
Shq1-202ENSMUST00000113312 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.2■■□□□ 1.78
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zeb1Q64318 1117 aa26.19■■□□□ 1.78
Shq1-202ENSMUST00000113312 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.96■■□□□ 1.75
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gab3Q8BSM5 595 aa25.84■■□□□ 1.73
Shq1-202ENSMUST00000113312 Npm2Q80W85 207 aa25.78■■□□□ 1.72
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.65■■□□□ 1.7
Shq1-202ENSMUST00000113312 Myt1lP97500 1187 aa25.63■■□□□ 1.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Amer1Q7TS75 1132 aa25.6■■□□□ 1.69
Shq1-202ENSMUST00000113312 Slc24a1Q91WD8 1130 aa25.3■■□□□ 1.64
Shq1-202ENSMUST00000113312 UbtfP25976 765 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Shq1-202ENSMUST00000113312 Trim41Q5NCC3 630 aa24.75■■□□□ 1.55
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24.73■■□□□ 1.55
Shq1-202ENSMUST00000113312 Il27Q8K3I6 234 aa24.65■■□□□ 1.54
Shq1-202ENSMUST00000113312 Os9Q8K2C7 672 aa24.55■■□□□ 1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 Neurod1Q60867 357 aa24.55■■□□□ 1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa24.48■■□□□ 1.51
Shq1-202ENSMUST00000113312 CenpbP27790 599 aa24.42■■□□□ 1.5
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.41■■□□□ 1.5
Shq1-202ENSMUST00000113312 4933416C03RikQ3V063 378 aa24.29■■□□□ 1.48
Shq1-202ENSMUST00000113312 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Shq1-202ENSMUST00000113312 Stra8P70278 393 aa24.27■■□□□ 1.48
Shq1-202ENSMUST00000113312 HrcG5E8J6 738 aa24.19■■□□□ 1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Chic1Q8CBW7 227 aa24.18■■□□□ 1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa24.15■■□□□ 1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.1■■□□□ 1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 NrdcQ8BHG1 1161 aa24.07■■□□□ 1.44
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa24■■□□□ 1.43
Shq1-202ENSMUST00000113312 NeflP08551 543 aa24■■□□□ 1.43
Shq1-202ENSMUST00000113312 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm13697A2AK42 830 aa23.96■■□□□ 1.43
Shq1-202ENSMUST00000113312 Plppr3Q7TPB0 716 aa23.93■■□□□ 1.42
Shq1-202ENSMUST00000113312 NclP09405 707 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Shq1-202ENSMUST00000113312 NefmP08553 848 aa23.87■■□□□ 1.41
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zbtb4Q5F293 982 aa23.75■■□□□ 1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Atp1b4Q99ME6 356 aa23.71■■□□□ 1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa23.7■■□□□ 1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Shq1-202ENSMUST00000113312 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Shq1-202ENSMUST00000113312 Erich6D3Z6S9 713 aa23.53■■□□□ 1.36
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm13695A2AK44 830 aa23.46■■□□□ 1.35
Shq1-202ENSMUST00000113312 Polr3glQ8R0C0 218 aa23.45■■□□□ 1.34
Shq1-202ENSMUST00000113312 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Shq1-202ENSMUST00000113312 ArxO35085 564 aa23.38■■□□□ 1.33
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lmod2Q3UHZ5 550 aa23.35■■□□□ 1.33
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nlrp6Q91WS2 869 aa23.28■■□□□ 1.32
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa23.26■■□□□ 1.31
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tnnt3Q9QZ47 272 aa23.23■■□□□ 1.31
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Shq1-202ENSMUST00000113312 NischQ80TM9 1593 aa23.17■■□□□ 1.3
Shq1-202ENSMUST00000113312 TonslQ6NZL6 1363 aa23.15■■□□□ 1.3
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa23.07■■□□□ 1.28
Shq1-202ENSMUST00000113312 DaxxO35613 739 aa23.05■■□□□ 1.28
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Shq1-202ENSMUST00000113312 Myt1Q8CFC2 1127 aa23.03■■□□□ 1.28
Shq1-202ENSMUST00000113312 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Shq1-202ENSMUST00000113312 Abcc9P70170 1546 aa22.97■■□□□ 1.27
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.94■■□□□ 1.26
Shq1-202ENSMUST00000113312 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.93■■□□□ 1.26
Shq1-202ENSMUST00000113312 Csrnp3P59055 597 aa22.92■■□□□ 1.26
Shq1-202ENSMUST00000113312 CatipB9EKE5 520 aa22.91■■□□□ 1.26
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
Shq1-202ENSMUST00000113312 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Shq1-202ENSMUST00000113312 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mier1Q5UAK0 511 aa22.73■■□□□ 1.23
Shq1-202ENSMUST00000113312 Irx6Q9ER75 438 aa22.73■■□□□ 1.23
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.69■■□□□ 1.22
Shq1-202ENSMUST00000113312 P3h3Q8CG70 732 aa22.67■■□□□ 1.22
Shq1-202ENSMUST00000113312 Vsig10D3YX43 558 aa22.66■■□□□ 1.22
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lmod3E9QA62 571 aa22.65■■□□□ 1.22
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.64■■□□□ 1.21
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Shq1-202ENSMUST00000113312 Eid3Q3V124 375 aa22.55■■□□□ 1.2
Shq1-202ENSMUST00000113312 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Shq1-202ENSMUST00000113312 Trim26Q99PN3 545 aa22.51■■□□□ 1.19
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.49■■□□□ 1.19
Shq1-202ENSMUST00000113312 Znf326O88291 580 aa22.46■■□□□ 1.19
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.43■■□□□ 1.18
Shq1-202ENSMUST00000113312 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fgd1P52734 960 aa22.41■■□□□ 1.18
Shq1-202ENSMUST00000113312 Anp32aO35381 247 aa22.41■■□□□ 1.18
Shq1-202ENSMUST00000113312 Clstn1Q9EPL2 979 aa22.41■■□□□ 1.18
Shq1-202ENSMUST00000113312 Chic2Q9D9G3 165 aa22.28■■□□□ 1.16
Shq1-202ENSMUST00000113312 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Shq1-202ENSMUST00000113312 MyclP10166 368 aa22.24■■□□□ 1.15
Shq1-202ENSMUST00000113312 ClspnQ80YR7 1315 aa22.2■■□□□ 1.14
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rtl1Q7M732 1744 aa22.18■■□□□ 1.14
Shq1-202ENSMUST00000113312 NgefQ8CHT1 710 aa22.18■■□□□ 1.14
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