RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa27.63■■■□□ 2.01
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Abcc9P70170 1546 aa26.39■■□□□ 1.81
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Abcc8B2RUS7 1588 aa26.34■■□□□ 1.81
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ScribQ80U72 1612 aa25.38■■□□□ 1.65
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NacadQ5SWP3 1504 aa24.6■■□□□ 1.53
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kdm5dQ62240 1548 aa24.56■■□□□ 1.52
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.29■■□□□ 1.48
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.11■■□□□ 1.45
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BicraF8VPZ9 1578 aa23.76■■□□□ 1.39
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.74■■□□□ 1.39
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Phf23Q8BSN5 401 aa23.73■■□□□ 1.39
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.45■■□□□ 1.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.42■■□□□ 1.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Baz1aO88379 1555 aa23.42■■□□□ 1.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Crybg2B7ZCC2 1516 aa23.35■■□□□ 1.33
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.63■■□□□ 1.21
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.62■■□□□ 1.21
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.42■■□□□ 1.18
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.41■■□□□ 1.18
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.35■■□□□ 1.17
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rtl1Q7M732 1744 aa22.33■■□□□ 1.17
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.12■■□□□ 1.13
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.08■■□□□ 1.12
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22■■□□□ 1.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.97■■□□□ 1.11
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa21.93■■□□□ 1.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plppr3Q7TPB0 716 aa21.93■■□□□ 1.1
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrc2Q64449 1479 aa21.87■■□□□ 1.09
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim41Q5NCC3 630 aa21.66■■□□□ 1.06
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.54■■□□□ 1.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cux2P70298 1426 aa21.53■■□□□ 1.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lamc3Q9R0B6 1581 aa21.5■■□□□ 1.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.36■■□□□ 1.01
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kif21aQ9QXL2 1672 aa21.35■■□□□ 1.01
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.17■□□□□ 0.98
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.14■□□□□ 0.97
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Camsap1A2AHC3 1581 aa21.11■□□□□ 0.97
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fmn1Q05860 1466 aa21.08■□□□□ 0.97
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Il27Q8K3I6 234 aa21.03■□□□□ 0.96
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plb1Q3TTY0 1478 aa21■□□□□ 0.95
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.98■□□□□ 0.95
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ift140E9PY46 1464 aa20.86■□□□□ 0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.84■□□□□ 0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnajc5P60904 198 aa20.83■□□□□ 0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Duox2A2AQ99 1517 aa20.83■□□□□ 0.92
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rusc2Q80U22 1514 aa20.78■□□□□ 0.92
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa20.72■□□□□ 0.91
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Samd9lQ69Z37 1561 aa20.68■□□□□ 0.9
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rad54l2Q99NG0 1466 aa20.5■□□□□ 0.87
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Setd1bQ8CFT2 1985 aa20.5■□□□□ 0.87
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Grin2aP35436 1464 aa20.49■□□□□ 0.87
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.49■□□□□ 0.87
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PtprkP35822 1457 aa20.45■□□□□ 0.86
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpatch8A2A6A1 1505 aa20.44■□□□□ 0.86
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kcna4Q61423 654 aa20.42■□□□□ 0.86
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Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam163aQ8CAA5 168 aa20.37■□□□□ 0.85
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