RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000058045.4

Garem2-201, Transcript of GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Garem2, Length 3,865 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rhox8Q6VSS7 320 aa26.13■■□□□ 1.77
Garem2-201ENSMUST00000058045 NischQ80TM9 1593 aa25■■□□□ 1.59
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.79■■□□□ 1.56
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Garem2-201ENSMUST00000058045 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.89■■□□□ 1.42
Garem2-201ENSMUST00000058045 Abcc9P70170 1546 aa23.83■■□□□ 1.4
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.74■■□□□ 1.39
Garem2-201ENSMUST00000058045 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.62■■□□□ 1.37
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rtl1Q7M732 1744 aa23.53■■□□□ 1.36
Garem2-201ENSMUST00000058045 Trim41Q5NCC3 630 aa23.39■■□□□ 1.34
Garem2-201ENSMUST00000058045 Zeb1Q64318 1117 aa23.36■■□□□ 1.33
Garem2-201ENSMUST00000058045 HrcG5E8J6 738 aa23.24■■□□□ 1.31
Garem2-201ENSMUST00000058045 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.21■■□□□ 1.31
Garem2-201ENSMUST00000058045 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Garem2-201ENSMUST00000058045 Gab3Q8BSM5 595 aa23.14■■□□□ 1.3
Garem2-201ENSMUST00000058045 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Garem2-201ENSMUST00000058045 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.94■■□□□ 1.26
Garem2-201ENSMUST00000058045 Wdr66E9Q743 1299 aa22.88■■□□□ 1.25
Garem2-201ENSMUST00000058045 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.85■■□□□ 1.25
Garem2-201ENSMUST00000058045 Neurod1Q60867 357 aa22.69■■□□□ 1.22
Garem2-201ENSMUST00000058045 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.66■■□□□ 1.22
Garem2-201ENSMUST00000058045 NefmP08553 848 aa22.6■■□□□ 1.21
Garem2-201ENSMUST00000058045 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.45■■□□□ 1.18
Garem2-201ENSMUST00000058045 UbtfP25976 765 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Garem2-201ENSMUST00000058045 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Garem2-201ENSMUST00000058045 Mier1Q5UAK0 511 aa22.38■■□□□ 1.17
Garem2-201ENSMUST00000058045 Sall2Q9QX96 1004 aa22.31■■□□□ 1.16
Garem2-201ENSMUST00000058045 Myt1lP97500 1187 aa22.26■■□□□ 1.15
Garem2-201ENSMUST00000058045 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Garem2-201ENSMUST00000058045 CenpbP27790 599 aa22.17■■□□□ 1.14
Garem2-201ENSMUST00000058045 Csrnp3P59055 597 aa22.14■■□□□ 1.14
Garem2-201ENSMUST00000058045 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Garem2-201ENSMUST00000058045 Chic1Q8CBW7 227 aa22.11■■□□□ 1.13
Garem2-201ENSMUST00000058045 Cep164Q5DU05 1446 aa22.05■■□□□ 1.12
Garem2-201ENSMUST00000058045 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21.99■■□□□ 1.11
Garem2-201ENSMUST00000058045 Npm2Q80W85 207 aa21.98■■□□□ 1.11
Garem2-201ENSMUST00000058045 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.96■■□□□ 1.11
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.95■■□□□ 1.1
Garem2-201ENSMUST00000058045 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa21.95■■□□□ 1.1
Garem2-201ENSMUST00000058045 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Garem2-201ENSMUST00000058045 ClspnQ80YR7 1315 aa21.74■■□□□ 1.07
Garem2-201ENSMUST00000058045 TonslQ6NZL6 1363 aa21.72■■□□□ 1.07
Garem2-201ENSMUST00000058045 Myt1Q8CFC2 1127 aa21.63■■□□□ 1.05
Garem2-201ENSMUST00000058045 Aplp2Q06335 707 aa21.58■■□□□ 1.04
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Garem2-201ENSMUST00000058045 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa21.55■■□□□ 1.04
Garem2-201ENSMUST00000058045 Baz1aO88379 1555 aa21.54■■□□□ 1.04
Garem2-201ENSMUST00000058045 Slc24a1Q91WD8 1130 aa21.51■■□□□ 1.03
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa21.49■■□□□ 1.03
Garem2-201ENSMUST00000058045 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.48■■□□□ 1.03
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ube2uB1AUC4 352 aa21.46■■□□□ 1.03
Garem2-201ENSMUST00000058045 Eid3Q3V124 375 aa21.46■■□□□ 1.03
Garem2-201ENSMUST00000058045 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.36■■□□□ 1.01
Garem2-201ENSMUST00000058045 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
Garem2-201ENSMUST00000058045 NclP09405 707 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.3■■□□□ 1
Garem2-201ENSMUST00000058045 Il27Q8K3I6 234 aa21.3■■□□□ 1
Garem2-201ENSMUST00000058045 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Garem2-201ENSMUST00000058045 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
Garem2-201ENSMUST00000058045 Stra8P70278 393 aa21.26■□□□□ 0.99
Garem2-201ENSMUST00000058045 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Garem2-201ENSMUST00000058045 Kdm5dQ62240 1548 aa21.24■□□□□ 0.99
Garem2-201ENSMUST00000058045 ScribQ80U72 1612 aa21.19■□□□□ 0.98
Garem2-201ENSMUST00000058045 Fam71e1A1L3C1 212 aa21.16■□□□□ 0.98
Garem2-201ENSMUST00000058045 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Garem2-201ENSMUST00000058045 Golga3P55937 1487 aa21.16■□□□□ 0.98
Garem2-201ENSMUST00000058045 Clip1Q922J3 1391 aa21.14■□□□□ 0.97
Garem2-201ENSMUST00000058045 NacadQ5SWP3 1504 aa21.11■□□□□ 0.97
Garem2-201ENSMUST00000058045 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.1■□□□□ 0.97
Garem2-201ENSMUST00000058045 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Garem2-201ENSMUST00000058045 Anp32aO35381 247 aa21.01■□□□□ 0.95
Garem2-201ENSMUST00000058045 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.96■□□□□ 0.95
Garem2-201ENSMUST00000058045 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.86■□□□□ 0.93
Garem2-201ENSMUST00000058045 Calr4Q3TQS0 420 aa20.81■□□□□ 0.92
Garem2-201ENSMUST00000058045 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa20.77■□□□□ 0.92
Garem2-201ENSMUST00000058045 Bcl11aQ9QYE3 773 aa20.77■□□□□ 0.91
Garem2-201ENSMUST00000058045 NrdcQ8BHG1 1161 aa20.75■□□□□ 0.91
Garem2-201ENSMUST00000058045 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa20.7■□□□□ 0.9
Garem2-201ENSMUST00000058045 Amer1Q7TS75 1132 aa20.69■□□□□ 0.9
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rtl5Q5DTT4 599 aa20.67■□□□□ 0.9
Garem2-201ENSMUST00000058045 Cep162Q6ZQ06 1403 aa20.67■□□□□ 0.9
Garem2-201ENSMUST00000058045 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20.61■□□□□ 0.89
Garem2-201ENSMUST00000058045 BlmO88700 1416 aa20.58■□□□□ 0.88
Garem2-201ENSMUST00000058045 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.58■□□□□ 0.88
Garem2-201ENSMUST00000058045 Synj1Q8CHC4 1574 aa20.55■□□□□ 0.88
Garem2-201ENSMUST00000058045 P3h3Q8CG70 732 aa20.53■□□□□ 0.88
Garem2-201ENSMUST00000058045 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa20.52■□□□□ 0.88
Garem2-201ENSMUST00000058045 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Garem2-201ENSMUST00000058045 CftrP26361 1476 aa20.49■□□□□ 0.87
Garem2-201ENSMUST00000058045 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.48■□□□□ 0.87
Garem2-201ENSMUST00000058045 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Garem2-201ENSMUST00000058045 Sycp2Q9CUU3 1500 aa20.46■□□□□ 0.87
Garem2-201ENSMUST00000058045 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.46■□□□□ 0.87
Garem2-201ENSMUST00000058045 Eea1Q8BL66 1411 aa20.45■□□□□ 0.86
Garem2-201ENSMUST00000058045 Chic2Q9D9G3 165 aa20.44■□□□□ 0.86
Garem2-201ENSMUST00000058045 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Garem2-201ENSMUST00000058045 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67.7 ms