RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033498.9

Timm17b-201, Transcript of Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Timm17b, Length 2,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm17b-201ENSMUST00000033498 NischQ80TM9 1593 aa36.34■■■■□ 3.41
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa36.05■■■■□ 3.36
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Abcc9P70170 1546 aa35.24■■■■□ 3.23
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.74■■■■□ 3.15
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.92■■■□□ 2.86
Timm17b-201ENSMUST00000033498 ScribQ80U72 1612 aa32.77■■■□□ 2.84
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.2■■■□□ 2.75
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Kdm5dQ62240 1548 aa32.01■■■□□ 2.71
Timm17b-201ENSMUST00000033498 NacadQ5SWP3 1504 aa31.84■■■□□ 2.69
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.77■■■□□ 2.68
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rtl1Q7M732 1744 aa31.55■■■□□ 2.64
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Baz1aO88379 1555 aa31.37■■■□□ 2.61
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.29■■■□□ 2.6
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Sycp2Q9CUU3 1500 aa31.18■■■□□ 2.58
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30.93■■■□□ 2.54
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.65■■■□□ 2.5
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.6■■■□□ 2.49
Timm17b-201ENSMUST00000033498 BicraF8VPZ9 1578 aa30.59■■■□□ 2.49
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa30.14■■■□□ 2.42
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Trim41Q5NCC3 630 aa30■■■□□ 2.39
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.69■■■□□ 2.34
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Timm17b-201ENSMUST00000033498 CftrP26361 1476 aa29.6■■■□□ 2.33
Timm17b-201ENSMUST00000033498 HrcG5E8J6 738 aa29.6■■■□□ 2.33
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.42■■■□□ 2.3
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cngb1E1AZ71 1325 aa29.36■■■□□ 2.29
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa29.34■■■□□ 2.29
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Golga3P55937 1487 aa29.28■■■□□ 2.28
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Top2bQ64511 1612 aa29.02■■■□□ 2.24
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Chic1Q8CBW7 227 aa29.02■■■□□ 2.24
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cep164Q5DU05 1446 aa29■■■□□ 2.23
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.97■■■□□ 2.23
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28.9■■■□□ 2.22
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.87■■■□□ 2.21
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.83■■■□□ 2.21
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.78■■■□□ 2.2
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Fmn1Q05860 1466 aa28.64■■■□□ 2.18
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Gab3Q8BSM5 595 aa28.61■■■□□ 2.17
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28.49■■■□□ 2.15
Timm17b-201ENSMUST00000033498 TnnQ80Z71 1560 aa28.4■■■□□ 2.14
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.35■■■□□ 2.13
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.35■■■□□ 2.13
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Fam135aQ6NS59 1506 aa28.24■■■□□ 2.11
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28.21■■■□□ 2.11
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28.14■■■□□ 2.1
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Il27Q8K3I6 234 aa28.13■■■□□ 2.09
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.1■■■□□ 2.09
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Camsap1A2AHC3 1581 aa28.04■■■□□ 2.08
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cux2P70298 1426 aa28.03■■■□□ 2.08
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.96■■■□□ 2.07
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Npm2Q80W85 207 aa27.93■■■□□ 2.06
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cep162Q6ZQ06 1403 aa27.9■■■□□ 2.06
Timm17b-201ENSMUST00000033498 PtprkP35822 1457 aa27.88■■■□□ 2.05
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Grin2bQ01097 1482 aa27.81■■■□□ 2.04
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Myt1lP97500 1187 aa27.79■■■□□ 2.04
Timm17b-201ENSMUST00000033498 NrkQ9R0G8 1455 aa27.77■■■□□ 2.04
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Shroom4Q1W617 1475 aa27.74■■■□□ 2.03
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Timm17b-201ENSMUST00000033498 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.68■■■□□ 2.02
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Mrc2Q64449 1479 aa27.66■■■□□ 2.02
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.65■■■□□ 2.02
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Timm17b-201ENSMUST00000033498 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Duox2A2AQ99 1517 aa27.53■■■□□ 2
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Efcab5A0JP43 1406 aa27.51■■□□□ 1.99
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Zeb1Q64318 1117 aa27.51■■□□□ 1.99
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Kif21aQ9QXL2 1672 aa27.47■■□□□ 1.99
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa27.44■■□□□ 1.98
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Map3k1P53349 1493 aa27.43■■□□□ 1.98
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.4■■□□□ 1.98
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Clip1Q922J3 1391 aa27.35■■□□□ 1.97
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.34■■□□□ 1.97
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.32■■□□□ 1.96
Timm17b-201ENSMUST00000033498 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Rad54l2Q99NG0 1466 aa27.22■■□□□ 1.95
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Eea1Q8BL66 1411 aa27.22■■□□□ 1.95
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Plb1Q3TTY0 1478 aa27.2■■□□□ 1.94
Timm17b-201ENSMUST00000033498 SynmQ70IV5 1561 aa27.19■■□□□ 1.94
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Carmil1Q6EDY6 1374 aa27.17■■□□□ 1.94
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Setd5Q5XJV7 1441 aa27.17■■□□□ 1.94
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Arap1Q4LDD4 1452 aa27.15■■□□□ 1.94
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa27.14■■□□□ 1.93
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.13■■□□□ 1.93
Timm17b-201ENSMUST00000033498 UbtfP25976 765 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.08■■□□□ 1.93
Timm17b-201ENSMUST00000033498 Cux1P53564 1515 aa27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.9 ms