RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028981.8

Mapre1-201, Transcript of Microtubule-associated protein RP/EB family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Mapre1, Length 7,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa11.5□□□□□ -0.57
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Rhox8Q6VSS7 320 aa11.42□□□□□ -0.58
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Cngb1E1AZ71 1325 aa11.08□□□□□ -0.64
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Myt1Q8CFC2 1127 aa10.89□□□□□ -0.67
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
Mapre1-201ENSMUST00000028981 NischQ80TM9 1593 aa10.72□□□□□ -0.69
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Amer1Q7TS75 1132 aa10.67□□□□□ -0.7
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Mapre1-201ENSMUST00000028981 CenpbP27790 599 aa10.56□□□□□ -0.72
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa10.48□□□□□ -0.73
Mapre1-201ENSMUST00000028981 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Abcc9P70170 1546 aa10.12□□□□□ -0.79
Mapre1-201ENSMUST00000028981 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa10.1□□□□□ -0.79
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Rtl5Q5DTT4 599 aa10.1□□□□□ -0.79
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Gab3Q8BSM5 595 aa10.1□□□□□ -0.79
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Wdr66E9Q743 1299 aa10.1□□□□□ -0.79
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Trim41Q5NCC3 630 aa10.06□□□□□ -0.8
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Pcgf6Q99NA9 353 aa9.97□□□□□ -0.81
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Stra8P70278 393 aa9.94□□□□□ -0.82
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Zeb1Q64318 1117 aa9.94□□□□□ -0.82
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Abcc8B2RUS7 1588 aa9.93□□□□□ -0.82
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Mapre1-201ENSMUST00000028981 NefmP08553 848 aa9.89□□□□□ -0.83
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Tnnt3Q9QZ47 272 aa9.89□□□□□ -0.83
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa9.8□□□□□ -0.84
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ccdc180J3QNE4 1664 aa9.79□□□□□ -0.84
Mapre1-201ENSMUST00000028981 4933416C03RikQ3V063 378 aa9.79□□□□□ -0.84
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Myt1lP97500 1187 aa9.77□□□□□ -0.85
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa9.74□□□□□ -0.85
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
Mapre1-201ENSMUST00000028981 HrcG5E8J6 738 aa9.72□□□□□ -0.85
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Mapre1-201ENSMUST00000028981 UbtfP25976 765 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa9.68□□□□□ -0.86
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Rtl1Q7M732 1744 aa9.65□□□□□ -0.86
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Aplp2Q06335 707 aa9.64□□□□□ -0.87
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Npm2Q80W85 207 aa9.63□□□□□ -0.87
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Anp32aO35381 247 aa9.59□□□□□ -0.87
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Bcl11aQ9QYE3 773 aa9.53□□□□□ -0.88
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Chic1Q8CBW7 227 aa9.53□□□□□ -0.88
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Anks4bQ8K3X6 423 aa9.53□□□□□ -0.88
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Il27Q8K3I6 234 aa9.51□□□□□ -0.89
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Neurod1Q60867 357 aa9.47□□□□□ -0.89
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Mier1Q5UAK0 511 aa9.46□□□□□ -0.9
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa9.43□□□□□ -0.9
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ube2uB1AUC4 352 aa9.43□□□□□ -0.9
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Dcaf1Q80TR8 1506 aa9.43□□□□□ -0.9
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa9.41□□□□□ -0.9
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
Mapre1-201ENSMUST00000028981 NeflP08551 543 aa9.36□□□□□ -0.91
Mapre1-201ENSMUST00000028981 DaxxO35613 739 aa9.35□□□□□ -0.91
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Csrnp3P59055 597 aa9.34□□□□□ -0.91
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa9.34□□□□□ -0.91
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Sall2Q9QX96 1004 aa9.3□□□□□ -0.92
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Slc24a1Q91WD8 1130 aa9.28□□□□□ -0.92
Mapre1-201ENSMUST00000028981 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa9.28□□□□□ -0.92
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Eid3Q3V124 375 aa9.28□□□□□ -0.92
Mapre1-201ENSMUST00000028981 ClspnQ80YR7 1315 aa9.27□□□□□ -0.93
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa9.27□□□□□ -0.93
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Mapre1-201ENSMUST00000028981 NrdcQ8BHG1 1161 aa9.26□□□□□ -0.93
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Cep164Q5DU05 1446 aa9.24□□□□□ -0.93
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Gm38655A0A286YDK6 273 aa9.22□□□□□ -0.93
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Lmod2Q3UHZ5 550 aa9.2□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Irx3P81067 507 aa9.19□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Kdm5dQ62240 1548 aa9.18□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 CatipB9EKE5 520 aa9.17□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Baz1aO88379 1555 aa9.17□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ccdc27Q3V036 639 aa9.16□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 TonslQ6NZL6 1363 aa9.16□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Pknox2Q8BG99 474 aa9.15□□□□□ -0.94
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 ScribQ80U72 1612 aa9.13□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 NclP09405 707 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 NacadQ5SWP3 1504 aa9.12□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa9.1□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Fam71e1A1L3C1 212 aa9.09□□□□□ -0.95
Mapre1-201ENSMUST00000028981 BccipQ9CWI3 316 aa9.07□□□□□ -0.96
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Tnnt2P50752 301 aa9.07□□□□□ -0.96
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Clip1Q922J3 1391 aa9.05□□□□□ -0.96
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Calr4Q3TQS0 420 aa9.04□□□□□ -0.96
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Znf316Q6PGE4 1016 aa9.02□□□□□ -0.96
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 AU015836B2RUM3 263 aa9□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Golga3P55937 1487 aa9□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa9□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa9□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Trim44Q9QXA7 346 aa8.99□□□□□ -0.97
Mapre1-201ENSMUST00000028981 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90.9 ms