Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
BccipQ9CWI3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
BccipQ9CWI3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BccipQ9CWI3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BccipQ9CWI3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BccipQ9CWI3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
BccipQ9CWI3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
BccipQ9CWI3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
BccipQ9CWI3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BccipQ9CWI3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
BccipQ9CWI3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
BccipQ9CWI3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BccipQ9CWI3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
BccipQ9CWI3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BccipQ9CWI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BccipQ9CWI3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
BccipQ9CWI3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BccipQ9CWI3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BccipQ9CWI3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BccipQ9CWI3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BccipQ9CWI3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BccipQ9CWI3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BccipQ9CWI3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BccipQ9CWI3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BccipQ9CWI3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BccipQ9CWI3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BccipQ9CWI3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BccipQ9CWI3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BccipQ9CWI3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BccipQ9CWI3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BccipQ9CWI3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BccipQ9CWI3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BccipQ9CWI3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BccipQ9CWI3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BccipQ9CWI3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BccipQ9CWI3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BccipQ9CWI3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BccipQ9CWI3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BccipQ9CWI3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BccipQ9CWI3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BccipQ9CWI3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BccipQ9CWI3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BccipQ9CWI3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BccipQ9CWI3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BccipQ9CWI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BccipQ9CWI3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BccipQ9CWI3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BccipQ9CWI3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
BccipQ9CWI3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BccipQ9CWI3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BccipQ9CWI3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BccipQ9CWI3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BccipQ9CWI3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BccipQ9CWI3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BccipQ9CWI3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BccipQ9CWI3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BccipQ9CWI3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BccipQ9CWI3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BccipQ9CWI3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BccipQ9CWI3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BccipQ9CWI3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BccipQ9CWI3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BccipQ9CWI3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
BccipQ9CWI3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BccipQ9CWI3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BccipQ9CWI3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BccipQ9CWI3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BccipQ9CWI3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BccipQ9CWI3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
BccipQ9CWI3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BccipQ9CWI3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BccipQ9CWI3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
BccipQ9CWI3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BccipQ9CWI3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
BccipQ9CWI3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
BccipQ9CWI3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BccipQ9CWI3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BccipQ9CWI3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BccipQ9CWI3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
BccipQ9CWI3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BccipQ9CWI3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
BccipQ9CWI3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
BccipQ9CWI3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
BccipQ9CWI3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BccipQ9CWI3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BccipQ9CWI3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BccipQ9CWI3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BccipQ9CWI3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BccipQ9CWI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BccipQ9CWI3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BccipQ9CWI3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BccipQ9CWI3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BccipQ9CWI3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BccipQ9CWI3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BccipQ9CWI3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
BccipQ9CWI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
BccipQ9CWI3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BccipQ9CWI3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
BccipQ9CWI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
BccipQ9CWI3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms