RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027185.10

Stradb-201, Transcript of STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Stradb, Length 2,960 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stradb-201ENSMUST00000027185 NischQ80TM9 1593 aa34.05■■■■□ 3.04
Stradb-201ENSMUST00000027185 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa33.63■■■□□ 2.97
Stradb-201ENSMUST00000027185 Abcc9P70170 1546 aa32.91■■■□□ 2.86
Stradb-201ENSMUST00000027185 Abcc8B2RUS7 1588 aa32.54■■■□□ 2.8
Stradb-201ENSMUST00000027185 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.07■■■□□ 2.56
Stradb-201ENSMUST00000027185 ScribQ80U72 1612 aa30.92■■■□□ 2.54
Stradb-201ENSMUST00000027185 Kdm5dQ62240 1548 aa30.12■■■□□ 2.41
Stradb-201ENSMUST00000027185 NacadQ5SWP3 1504 aa29.83■■■□□ 2.37
Stradb-201ENSMUST00000027185 Dcaf1Q80TR8 1506 aa29.82■■■□□ 2.36
Stradb-201ENSMUST00000027185 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.8■■■□□ 2.36
Stradb-201ENSMUST00000027185 Baz1aO88379 1555 aa29.3■■■□□ 2.28
Stradb-201ENSMUST00000027185 Sycp2Q9CUU3 1500 aa29.26■■■□□ 2.27
Stradb-201ENSMUST00000027185 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.01■■■□□ 2.24
Stradb-201ENSMUST00000027185 Rtl1Q7M732 1744 aa28.98■■■□□ 2.23
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ccdc180J3QNE4 1664 aa28.91■■■□□ 2.22
Stradb-201ENSMUST00000027185 BicraF8VPZ9 1578 aa28.85■■■□□ 2.21
Stradb-201ENSMUST00000027185 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.64■■■□□ 2.18
Stradb-201ENSMUST00000027185 Smarca2Q6DIC0 1577 aa28.56■■■□□ 2.16
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa28.42■■■□□ 2.14
Stradb-201ENSMUST00000027185 Trim41Q5NCC3 630 aa28■■■□□ 2.07
Stradb-201ENSMUST00000027185 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.89■■■□□ 2.05
Stradb-201ENSMUST00000027185 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
Stradb-201ENSMUST00000027185 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cngb1E1AZ71 1325 aa27.76■■■□□ 2.03
Stradb-201ENSMUST00000027185 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Stradb-201ENSMUST00000027185 CftrP26361 1476 aa27.71■■■□□ 2.03
Stradb-201ENSMUST00000027185 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa27.6■■■□□ 2.01
Stradb-201ENSMUST00000027185 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Stradb-201ENSMUST00000027185 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.51■■□□□ 1.99
Stradb-201ENSMUST00000027185 Chic1Q8CBW7 227 aa27.32■■□□□ 1.96
Stradb-201ENSMUST00000027185 Golga3P55937 1487 aa27.31■■□□□ 1.96
Stradb-201ENSMUST00000027185 HrcG5E8J6 738 aa27.27■■□□□ 1.96
Stradb-201ENSMUST00000027185 Frmpd1A2AKB4 1549 aa27.22■■□□□ 1.95
Stradb-201ENSMUST00000027185 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.18■■□□□ 1.94
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ercc6F8VPZ5 1481 aa27.14■■□□□ 1.94
Stradb-201ENSMUST00000027185 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.14■■□□□ 1.93
Stradb-201ENSMUST00000027185 Wdr62Q3U3T8 1523 aa27.13■■□□□ 1.93
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa27.09■■□□□ 1.93
Stradb-201ENSMUST00000027185 Gab3Q8BSM5 595 aa27.09■■□□□ 1.93
Stradb-201ENSMUST00000027185 Top2bQ64511 1612 aa27.06■■□□□ 1.92
Stradb-201ENSMUST00000027185 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Stradb-201ENSMUST00000027185 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.93■■□□□ 1.9
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cep164Q5DU05 1446 aa26.87■■□□□ 1.89
Stradb-201ENSMUST00000027185 Il27Q8K3I6 234 aa26.8■■□□□ 1.88
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ubl4bQ9CQ84 188 aa26.76■■□□□ 1.87
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Stradb-201ENSMUST00000027185 Kif15Q6P9L6 1387 aa26.74■■□□□ 1.87
Stradb-201ENSMUST00000027185 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Stradb-201ENSMUST00000027185 Fmn1Q05860 1466 aa26.69■■□□□ 1.86
Stradb-201ENSMUST00000027185 Fam135aQ6NS59 1506 aa26.54■■□□□ 1.84
Stradb-201ENSMUST00000027185 Lamc3Q9R0B6 1581 aa26.51■■□□□ 1.83
Stradb-201ENSMUST00000027185 TnnQ80Z71 1560 aa26.49■■□□□ 1.83
Stradb-201ENSMUST00000027185 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cux2P70298 1426 aa26.44■■□□□ 1.82
Stradb-201ENSMUST00000027185 Npm2Q80W85 207 aa26.33■■□□□ 1.81
Stradb-201ENSMUST00000027185 Myt1lP97500 1187 aa26.3■■□□□ 1.8
Stradb-201ENSMUST00000027185 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Stradb-201ENSMUST00000027185 Camsap1A2AHC3 1581 aa26.29■■□□□ 1.8
Stradb-201ENSMUST00000027185 PtprkP35822 1457 aa26.23■■□□□ 1.79
Stradb-201ENSMUST00000027185 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.21■■□□□ 1.79
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ccdc18Q640L5 1455 aa26.19■■□□□ 1.78
Stradb-201ENSMUST00000027185 Mrc2Q64449 1479 aa26.09■■□□□ 1.77
Stradb-201ENSMUST00000027185 Zeb1Q64318 1117 aa26.06■■□□□ 1.76
Stradb-201ENSMUST00000027185 Grin2bQ01097 1482 aa26.04■■□□□ 1.76
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.03■■□□□ 1.76
Stradb-201ENSMUST00000027185 Kif21aQ9QXL2 1672 aa25.99■■□□□ 1.75
Stradb-201ENSMUST00000027185 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Stradb-201ENSMUST00000027185 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Stradb-201ENSMUST00000027185 Shroom4Q1W617 1475 aa25.91■■□□□ 1.74
Stradb-201ENSMUST00000027185 Duox2A2AQ99 1517 aa25.87■■□□□ 1.73
Stradb-201ENSMUST00000027185 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Stradb-201ENSMUST00000027185 NrkQ9R0G8 1455 aa25.85■■□□□ 1.73
Stradb-201ENSMUST00000027185 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.85■■□□□ 1.73
Stradb-201ENSMUST00000027185 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.81■■□□□ 1.72
Stradb-201ENSMUST00000027185 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa25.77■■□□□ 1.72
Stradb-201ENSMUST00000027185 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Stradb-201ENSMUST00000027185 Samd9lQ69Z37 1561 aa25.75■■□□□ 1.71
Stradb-201ENSMUST00000027185 Rad54l2Q99NG0 1466 aa25.74■■□□□ 1.71
Stradb-201ENSMUST00000027185 Crocc2F6XLV1 1638 aa25.71■■□□□ 1.71
Stradb-201ENSMUST00000027185 Plb1Q3TTY0 1478 aa25.7■■□□□ 1.7
Stradb-201ENSMUST00000027185 Efcab5A0JP43 1406 aa25.67■■□□□ 1.7
Stradb-201ENSMUST00000027185 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa25.64■■□□□ 1.69
Stradb-201ENSMUST00000027185 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Stradb-201ENSMUST00000027185 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa25.59■■□□□ 1.69
Stradb-201ENSMUST00000027185 Clip1Q922J3 1391 aa25.56■■□□□ 1.68
Stradb-201ENSMUST00000027185 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa25.56■■□□□ 1.68
Stradb-201ENSMUST00000027185 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Stradb-201ENSMUST00000027185 SynmQ70IV5 1561 aa25.46■■□□□ 1.67
Stradb-201ENSMUST00000027185 Map3k1P53349 1493 aa25.44■■□□□ 1.66
Stradb-201ENSMUST00000027185 Setd5Q5XJV7 1441 aa25.44■■□□□ 1.66
Stradb-201ENSMUST00000027185 Disp1Q3TDN0 1521 aa25.41■■□□□ 1.66
Stradb-201ENSMUST00000027185 Cux1P53564 1515 aa25.4■■□□□ 1.66
Stradb-201ENSMUST00000027185 Arap1Q4LDD4 1452 aa25.38■■□□□ 1.65
Stradb-201ENSMUST00000027185 Setd1bQ8CFT2 1985 aa25.38■■□□□ 1.65
Stradb-201ENSMUST00000027185 Magi3Q9EQJ9 1476 aa25.37■■□□□ 1.65
Stradb-201ENSMUST00000027185 Pla2r1Q62028 1487 aa25.37■■□□□ 1.65
Stradb-201ENSMUST00000027185 Carmil1Q6EDY6 1374 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.5 ms