RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026125.2

Alyref-201, Transcript of THO complex subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Alyref, Length 3,527 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref-201ENSMUST00000026125 NischQ80TM9 1593 aa31.56■■■□□ 2.64
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.47■■■□□ 2.63
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa30.21■■■□□ 2.43
Alyref-201ENSMUST00000026125 Abcc9P70170 1546 aa30.19■■■□□ 2.42
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.7■■■□□ 2.35
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rtl1Q7M732 1744 aa29.7■■■□□ 2.34
Alyref-201ENSMUST00000026125 Abcc8B2RUS7 1588 aa29.65■■■□□ 2.34
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa29.62■■■□□ 2.33
Alyref-201ENSMUST00000026125 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.06■■■□□ 2.24
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pcgf6Q99NA9 353 aa29.06■■■□□ 2.24
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Alyref-201ENSMUST00000026125 HrcG5E8J6 738 aa28.61■■■□□ 2.17
Alyref-201ENSMUST00000026125 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trim41Q5NCC3 630 aa28.38■■■□□ 2.13
Alyref-201ENSMUST00000026125 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.36■■■□□ 2.13
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zeb1Q64318 1117 aa28.14■■■□□ 2.1
Alyref-201ENSMUST00000026125 Neurod1Q60867 357 aa28■■■□□ 2.07
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cngb1E1AZ71 1325 aa27.85■■■□□ 2.05
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gab3Q8BSM5 595 aa27.81■■■□□ 2.04
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa27.66■■■□□ 2.02
Alyref-201ENSMUST00000026125 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Alyref-201ENSMUST00000026125 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Alyref-201ENSMUST00000026125 ScribQ80U72 1612 aa27.53■■■□□ 2
Alyref-201ENSMUST00000026125 NefmP08553 848 aa27.42■■□□□ 1.98
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sall2Q9QX96 1004 aa27.42■■□□□ 1.98
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mier1Q5UAK0 511 aa27.41■■□□□ 1.98
Alyref-201ENSMUST00000026125 Kdm5dQ62240 1548 aa27.39■■□□□ 1.98
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cep164Q5DU05 1446 aa27.38■■□□□ 1.97
Alyref-201ENSMUST00000026125 Wdr66E9Q743 1299 aa27.34■■□□□ 1.97
Alyref-201ENSMUST00000026125 Chic1Q8CBW7 227 aa27.25■■□□□ 1.95
Alyref-201ENSMUST00000026125 Csrnp3P59055 597 aa27.2■■□□□ 1.95
Alyref-201ENSMUST00000026125 NacadQ5SWP3 1504 aa27.17■■□□□ 1.94
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa27.16■■□□□ 1.94
Alyref-201ENSMUST00000026125 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa27.14■■□□□ 1.94
Alyref-201ENSMUST00000026125 Baz1aO88379 1555 aa27.1■■□□□ 1.93
Alyref-201ENSMUST00000026125 UbtfP25976 765 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Alyref-201ENSMUST00000026125 Anks4bQ8K3X6 423 aa27.02■■□□□ 1.92
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
Alyref-201ENSMUST00000026125 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm38655A0A286YDK6 273 aa26.82■■□□□ 1.88
Alyref-201ENSMUST00000026125 Myt1lP97500 1187 aa26.79■■□□□ 1.88
Alyref-201ENSMUST00000026125 CenpbP27790 599 aa26.68■■□□□ 1.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.6■■□□□ 1.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Npm2Q80W85 207 aa26.57■■□□□ 1.84
Alyref-201ENSMUST00000026125 ClspnQ80YR7 1315 aa26.56■■□□□ 1.84
Alyref-201ENSMUST00000026125 Il27Q8K3I6 234 aa26.52■■□□□ 1.84
Alyref-201ENSMUST00000026125 Aplp2Q06335 707 aa26.49■■□□□ 1.83
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.47■■□□□ 1.83
Alyref-201ENSMUST00000026125 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.45■■□□□ 1.83
Alyref-201ENSMUST00000026125 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.4■■□□□ 1.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 TonslQ6NZL6 1363 aa26.38■■□□□ 1.81
Alyref-201ENSMUST00000026125 Golga3P55937 1487 aa26.28■■□□□ 1.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Myt1Q8CFC2 1127 aa26.28■■□□□ 1.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa26.16■■□□□ 1.78
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa26.07■■□□□ 1.76
Alyref-201ENSMUST00000026125 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.07■■□□□ 1.76
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa26.04■■□□□ 1.76
Alyref-201ENSMUST00000026125 Eid3Q3V124 375 aa26.02■■□□□ 1.76
Alyref-201ENSMUST00000026125 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam71e1A1L3C1 212 aa25.94■■□□□ 1.74
Alyref-201ENSMUST00000026125 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Alyref-201ENSMUST00000026125 Synj1Q8CHC4 1574 aa25.89■■□□□ 1.74
Alyref-201ENSMUST00000026125 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
Alyref-201ENSMUST00000026125 Clip1Q922J3 1391 aa25.81■■□□□ 1.72
Alyref-201ENSMUST00000026125 CftrP26361 1476 aa25.8■■□□□ 1.72
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tnnt3Q9QZ47 272 aa25.79■■□□□ 1.72
Alyref-201ENSMUST00000026125 BicraF8VPZ9 1578 aa25.76■■□□□ 1.71
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.66■■□□□ 1.7
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.63■■□□□ 1.69
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc24a1Q91WD8 1130 aa25.6■■□□□ 1.69
Alyref-201ENSMUST00000026125 NclP09405 707 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
Alyref-201ENSMUST00000026125 Bcl11aQ9QYE3 773 aa25.55■■□□□ 1.68
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.45■■□□□ 1.67
Alyref-201ENSMUST00000026125 Anp32aO35381 247 aa25.45■■□□□ 1.67
Alyref-201ENSMUST00000026125 Lmod2Q3UHZ5 550 aa25.45■■□□□ 1.66
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ube2uB1AUC4 352 aa25.44■■□□□ 1.66
Alyref-201ENSMUST00000026125 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Alyref-201ENSMUST00000026125 Stra8P70278 393 aa25.42■■□□□ 1.66
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ubl4bQ9CQ84 188 aa25.41■■□□□ 1.66
Alyref-201ENSMUST00000026125 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
Alyref-201ENSMUST00000026125 Top2bQ64511 1612 aa25.38■■□□□ 1.65
Alyref-201ENSMUST00000026125 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.37■■□□□ 1.65
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa25.33■■□□□ 1.65
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fmn1Q05860 1466 aa25.32■■□□□ 1.64
Alyref-201ENSMUST00000026125 Calr4Q3TQS0 420 aa25.27■■□□□ 1.64
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa25.26■■□□□ 1.63
Alyref-201ENSMUST00000026125 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa25.21■■□□□ 1.63
Alyref-201ENSMUST00000026125 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Alyref-201ENSMUST00000026125 Znf710Q3U288 666 aa25.2■■□□□ 1.63
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Alyref-201ENSMUST00000026125 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa25.19■■□□□ 1.62
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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