RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W CCE1Q03702 353 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VTA1Q06263 330 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MAS1P10507 462 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RGP1P16664 663 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YKL075CP36083 450 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W IFA38P38286 347 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W ERG7P38604 731 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W FTR1P40088 404 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W EMP47P43555 445 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YML020WQ03722 664 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SHE9Q04172 456 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W BSP1Q06604 576 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W TIP41Q12199 356 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W APE3P37302 537 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W HSM3P38348 480 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.9□□□□□ -1.95not detected
YML039WYML039W GIM3P53900 129 aa2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YML039WYML039W HIR3P47171 1648 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W CTM1P38818 585 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W NOC2P39744 710 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W LAM5P43560 674 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YOL098CQ12496 1037 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W OM45P16547 393 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W HEM3P28789 327 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SMI1P32566 505 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W UBP13P38187 747 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W ACA1P39970 489 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W PEX15Q08215 383 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W DBP5P20449 482 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SIT4P20604 311 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MEI4P29467 408 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W GPB2P39717 880 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W BUD16P39988 312 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RTT105P40063 208 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W IRC8P47046 822 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SHE10P53075 577 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W BIO5P53744 561 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W GDE1Q02979 1223 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95not detected
YML039WYML039W CSC1Q06538 782 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W ATG20Q07528 640 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MSD1P15179 658 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W NDI1P32340 513 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SSE1P32589 693 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RFC1P38630 861 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MXR1P40029 184 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W FAU1P40099 211 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W TPO2P53283 614 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VPS62P53285 467 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W ENT2Q05785 613 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RGA2Q06407 1009 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W TMA17Q12513 150 aa2.89□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W HES1P35843 434 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YLR001CQ07895 862 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W AUS1Q08409 1394 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MRPL32P25348 183 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W NIP100P33420 868 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W SPC34P36131 295 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MRPL40P36534 297 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YHL044WP38727 235 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VAC8P39968 578 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W PSY2P40164 858 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W NET1P47035 1189 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MDE1P47095 244 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W HXT16P47185 567 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W TOF2Q02208 771 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W PEX29Q03370 554 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VPS72Q03388 795 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RSF1Q05043 376 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W MHP1P43638 1398 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W KDX1P36005 433 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W PET10P36139 283 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W VPS27P40343 622 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YGR125WP53273 1036 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W TAP42Q04372 366 aa2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YML039WYML039W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
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