RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	PEX28	P38848	579 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	PIC2	P40035	300 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	FYV10	P40492	516 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	XKS1	P42826	600 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	VPS35	P34110	944 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	PTC7	P38797	343 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	YAR028W	P39548	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	GTS1	P40956	396 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	TPP1	Q03796	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	SPR28	Q04921	423 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	ADP1	P25371	1049 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	ASF1	P32447	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	NNK1	P36003	928 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RDH54	P38086	958 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	UBP5	P39944	805 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	CDA2	Q06703	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	SAM35	P14693	329 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RSM26	P47141	266 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	AFG2	P32794	780 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	ECL1	P48235	211 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	THI80	P35202	319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	ORC3	P54790	616 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	ADI1	Q03677	179 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR224W	YLR224W	MGE1	P38523	228 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	SHU2	P38957	223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	TAF1	P46677	1066 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	YJL045W	P47052	634 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	OXR1	Q08952	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	SEC8	P32855	1065 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	SQT1	P35184	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	YJR107W	P47145	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	NIT1	P40447	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YLR224W	YLR224W	CYC8	P14922	966 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	ADD66	P36040	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	GPB2	P39717	880 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	YGR122W	P53272	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	RAD2	P07276	1031 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	YHL012W	P38709	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	YFL054C	P43549	646 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	EST2	Q06163	884 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	SPO21	Q12411	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	KIP1	P28742	1111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	ROD1	Q02805	837 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	HDA2	Q06629	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	MRPL22	P53881	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	LAP2	Q10740	671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR224W	YLR224W	PEP7	P32609	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	YSC84	P32793	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	AIM26	P32858	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	HXT13	P39924	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	MRPS18	P42847	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	GNP1	P48813	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	HXT17	P53631	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	HXT15	P54854	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	RKM2	Q03942	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	RSC58	Q07979	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	ESC8	Q08119	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	GCR1	P07261	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	YCR015C	P25616	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	MDL2	P33311	773 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	ALG3	P38179	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	HSE1	P38753	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	MRL1	Q06815	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	MCD1	Q12158	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	PTC5	Q12511	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	FLR1	P38124	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR224W	YLR224W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.8 ms