RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	VPS35	P34110	944 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	SQT1	P35184	431 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	NNK1	P36003	928 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	AOS1	Q06624	347 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YKL063C	YKL063C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	SHU2	P38957	223 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	PIC2	P40035	300 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	YJL045W	P47052	634 aa		5	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	YPL109C	Q02981	657 aa		5	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	OXR1	Q08952	273 aa		5	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	ADI1	Q03677	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	CDA2	Q06703	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	SAM35	P14693	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	MCM2	P29469	868 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	RDH54	P38086	958 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	GPB2	P39717	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	UBP5	P39944	805 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	ECL1	P48235	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YKL063C	YKL063C	AFG2	P32794	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	YHL012W	P38709	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKL063C	YKL063C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	ATG14	P38270	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	ATE1	P16639	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	AIM26	P32858	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	ADD66	P36040	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	EST2	Q06163	884 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	LAP2	Q10740	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	ROD1	Q02805	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	SPR28	Q04921	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	KIP1	P28742	1111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	SEC20	P28791	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	HSE1	P38753	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	HDA2	Q06629	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	NIT1	P40447	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	YFL054C	P43549	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	TAF1	P46677	1066 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	MRPL22	P53881	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	ORC3	P54790	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YKL063C	YKL063C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	PTC5	Q12511	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	YSC84	P32793	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	THI80	P35202	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	ALG3	P38179	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	POL32	P47110	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	SPO21	Q12411	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL063C	YKL063C	RAD2	P07276	1031 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	FYV10	P40492	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	YGR122W	P53272	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	YML020W	Q03722	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	TAF7	Q05021	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	CYC8	P14922	966 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	MDL2	P33311	773 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	MRPS18	P42847	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	RKM2	Q03942	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	MRL1	Q06815	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	GCR1	P07261	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	VPS53	P47061	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	ESC8	Q08119	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	MKK2	P32491	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	YKL222C	P35995	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	HXT13	P39924	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	HXT17	P53631	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	HXT15	P54854	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	TOD6	P34219	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	MCD1	Q12158	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	SPS1	P08458	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	YCR015C	P25616	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	PEP7	P32609	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	SEC8	P32855	1065 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL063C	YKL063C	SLD2	P34252	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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