RNA–Protein interactions for RNA: YJR001W

AVT1, Transcript of Vacuolar transporter, yeast

Gene AVT1, Length 1,809 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT1	YJR001W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	CLC1	P17891	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	RPC82	P32349	654 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ANP1	P32629	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	SAS3	P34218	831 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	SIC1	P38634	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	BNA1	P47096	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	KEL2	P50090	882 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	TFB2	Q02939	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	SPO14	P36126	1683 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	CCP1	P00431	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	GAL1	P04385	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	APL6	P46682	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	MET14	Q02196	202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	TRS33	Q99394	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	EUG1	P32474	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PTH2	P34222	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PEX5	P35056	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ESL1	P40456	1118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PEX14	P53112	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YGR016W	P53209	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	UFD2	P54860	961 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YML131W	Q03102	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	UGO1	Q03327	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	FRA1	Q07825	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	THI73	Q07904	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PSR2	Q07949	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	OXR1	Q08952	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	APC11	Q12157	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	NFI1	Q12216	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	GLE1	Q12315	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PLC1	P32383	869 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	HXT5	P38695	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	YHR218W	P38899	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	FAA3	P39002	694 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	ATG3	P40344	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	VTC2	P43585	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	REH1	Q06709	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	CDC45	Q08032	650 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	PDR10	P51533	1564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AVT1	YJR001W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RXT2	P38255	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YBR184W	P38299	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SOH1	P38633	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YHL008C	P38750	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CDC55	Q00362	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	UME1	Q03010	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SPC19	Q03954	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SPO75	Q07798	868 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MSB4	Q12317	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MED1	Q12321	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CMP2	P14747	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	UBP1	P25037	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	IMP2'	P32351	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MNT3	P40549	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	GYP7	P48365	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	UBA2	P52488	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SCY1	P53009	804 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YNL193W	P53870	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YNL115C	P53925	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	COG8	Q04632	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	PCL8	Q08966	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NUP145	P49687	1317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	PTP2	P29461	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	HSP78	P33416	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RPC37	P36121	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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