RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	DSE4	P53753	1117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	TDA6	Q06466	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	GAS5	Q08193	484 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	YTA7	P40340	1379 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	HIF1	Q12373	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RIM4	YHL024W	SPC110	P32380	944 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	VAC8	P39968	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	BUD9	P53226	547 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SIW14	P53965	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
RIM4	YHL024W	TOA1	P32773	286 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YGR053C	P53234	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	NSG2	P53898	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	FAR11	P53917	953 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	EEB1	Q02891	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	NCE103	P53615	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SPO74	P45819	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	ROD1	Q02805	837 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	EST2	Q06163	884 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	AFG2	P32794	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	ADD66	P36040	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	ENT3	P47160	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	AI3	P03877	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SFA1	P32771	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	RER2	P35196	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	PRY1	P47032	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YGR045C	P53229	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	TLG1	Q03322	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	MKK2	P32491	506 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SWE1	P32944	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	CWC24	P53769	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	VPS4	P52917	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	RKM2	Q03942	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	RAD27	P26793	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RIM4	YHL024W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	IME2	P32581	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	OCA5	P38738	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YAR028W	P39548	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YNR063W	P53749	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	DOS2	P54858	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	YKL069W	P36088	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	PHM7	Q12252	991 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM4	YHL024W	LYP1	P32487	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	GPT2	P36148	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	OPI10	Q08202	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	UFD4	P33202	1483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	PRI2	P20457	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	RSC6	P25632	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	SKN7	P38889	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	ICP55	P40051	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	TYW3	P53177	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	HSL1	P34244	1518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	ALG3	P38179	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	TAT2	P38967	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	NNF1	P47149	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	NNF2	P53253	936 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	ESC2	Q06340	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM4	YHL024W	SEA4	P38164	1038 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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