RNA–Protein interactions for RNA: YGL174W

BUD13, Transcript of Subunit of the RES complex, yeast

Gene BUD13, Length 801 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD13	YGL174W	BDH2	P39713	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YBP2	P53169	641 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	BIK1	P11709	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RGP1	P16664	663 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	BIO2	P32451	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	BRL1	P38770	471 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	UBP12	P39538	1254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YJR008W	P47085	338 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RMT2	Q03305	412 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	ATG13	Q06628	738 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	MCM1	P11746	286 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	MLC1	P53141	149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RSC1	P53236	928 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	HST1	P53685	503 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YNL165W	P53891	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RIM20	Q12033	661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	ENT1	Q12518	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	MNN4	P36044	1178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YKL133C	P36066	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YTA6	P40328	754 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	CIR1	P42940	261 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YGL242C	P53066	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	MRPS35	P53292	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	LCD1	Q04377	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RSM25	P40496	264 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	PKH1	Q03407	766 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	SSP2	Q08646	371 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	NHA1	Q99271	985 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	PKC1	P24583	1151 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RPN12	P32496	274 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RKM3	P38222	552 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	BUD9	P53226	547 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	MDG1	P53885	366 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	YNL108C	P53929	270 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BUD13	YGL174W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	DID4	P36108	232 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	OMA1	P36163	345 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	ALG14	P38242	237 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	RIM21	P48565	533 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	INP52	P50942	1183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PEX14	P53112	341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	CTR9	P89105	1077 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	FCP1	Q03254	732 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	HEH2	Q03281	663 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	APC11	Q12157	165 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	MLF3	P32047	452 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	MIC60	P36112	540 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	TCB2	P48231	1178 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	CTF18	P49956	741 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PIB2	P53191	635 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PEX19	Q07418	342 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	AIM44	Q99299	758 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	COB	P00163	385 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PBY1	P38254	753 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	PRK1	P40494	810 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	SPO22	P40511	975 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	IRC24	P40580	263 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	ENT3	P47160	408 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	CWH41	P53008	833 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	ARP5	P53946	755 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	MCM2	P29469	868 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	TTI1	P36097	1038 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	VID28	P40547	921 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	YGL082W	P53155	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD13	YGL174W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms