RNA–Protein interactions for RNA: YGL017W

ATE1, Transcript of Arginyl-tRNA-protein transferase, yeast

Gene ATE1, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATE1	YGL017W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	UBX7	P38349	436 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SEC9	P40357	651 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	CTH1	P47976	325 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	CWH41	P53008	833 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	HXT17	P53631	564 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	APC11	Q12157	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SFI1	Q12369	946 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	CEP3	P40969	608 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	TY4A-J	P47023	414 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	FAR11	P53917	953 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	VPS60	Q03390	229 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	RCF1	Q03713	159 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SSP2	Q08646	371 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.05	□□□□□ -1.44	not detected
ATE1	YGL017W	GAL2	P13181	574 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SLD2	P34252	453 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	DID4	P36108	232 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	FRA1	Q07825	749 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	YDL176W	Q12027	708 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	PHM7	Q12252	991 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	MCM1	P11746	286 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	ELM1	P32801	640 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SOH1	P38633	127 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
ATE1	YGL017W	YPR084W	Q06821	456 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	PEX19	Q07418	342 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	YLL054C	Q12244	843 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	SRF1	Q12516	437 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	ATG3	P40344	310 aa		6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	NUP85	P46673	744 aa		6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	TIM50	Q02776	476 aa		6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
ATE1	YGL017W	YBR287W	P38355	427 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	PEX14	P53112	341 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	ALE1	Q08548	619 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	NYV1	Q12255	253 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	TOS1	P38288	455 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	OPT2	Q06593	877 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	COQ4	O13525	335 aa		6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	MSH3	P25336	1018 aa		6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	DEP1	P31385	405 aa		6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	PKH1	Q03407	766 aa		6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	YLR346C	Q06139	101 aa		6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	YOL057W	Q08225	711 aa		6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	NPR3	P38742	1146 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	ACO2	P39533	789 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	RNT1	Q02555	471 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	CLB1	P24868	471 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	PHO87	P25360	923 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	MRC1	P25588	1096 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	RAD24	P32641	659 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	SAP190	P36123	1033 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	LEM3	P42838	414 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	AAD14	P42884	376 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	DNM1	P54861	757 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	ARG82	P07250	355 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	ATE1	P16639	503 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	MNR2	P35724	969 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	YJR008W	P47085	338 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	SSL2	Q00578	843 aa		5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	BOI2	P39969	1040 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	APL6	P46682	809 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	MEH1	Q02205	184 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATE1	YGL017W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45

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