RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Siglec1Q62230 1695 aa26.56■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif24Q6NWW5 1356 aa26.56■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ChgaP26339 463 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CanxP35564 591 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ggnbp2Q5SV77 696 aa26.54■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tmem132eQ6IEE6 982 aa26.54■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slain2Q8CI08 581 aa26.54■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fmnl2A2APV2 1086 aa26.53■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnai1Q8C0M8 701 aa26.53■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kcna6Q61923 529 aa26.52■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa26.51■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cetn4Q8K4K1 168 aa26.51■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Amotl1Q9D4H4 968 aa26.51■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prim1P20664 417 aa26.5■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myo5bP21271 1818 aa26.49■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col18a1P39061 1774 aa26.48■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 LifrP42703 1092 aa26.47■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nid2O88322 1403 aa26.47■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Farp2Q91VS8 1065 aa26.46■■□□□ 1.83
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc27Q3V036 639 aa26.45■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cgnl1Q6AW69 1298 aa26.45■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sv2bQ8BG39 683 aa26.45■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif18aQ91WD7 886 aa26.45■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc12Q80WJ6 1366 aa26.44■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TnrQ8BYI9 1358 aa26.44■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pibf1E9Q6K3 756 aa26.44■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Snap23O09044 210 aa26.44■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnajc10Q9DC23 793 aa26.44■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Evi5lH3BKQ3 813 aa26.43■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gli3Q61602 1583 aa26.43■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Q3TQI7 289 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa26.43■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Phf23Q8BSN5 401 aa26.42■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tm6sf1P58749 370 aa26.41■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trim27Q62158 513 aa26.41■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atf5O70191 283 aa26.41■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aifm3Q3TY86 605 aa26.4■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Amotl2Q8K371 772 aa26.4■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pnmal2G3X9N3 661 aa26.39■■□□□ 1.82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rapgef3Q8VCC8 918 aa26.38■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fgd1P52734 960 aa26.38■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atf3Q60765 181 aa26.38■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dzip1Q8BMD2 852 aa26.38■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aldh8a1Q8BH00 487 aa26.37■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mre11Q61216 706 aa26.35■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Simc1E9Q6E9 1354 aa26.34■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa26.34■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rabep1O35551 862 aa26.33■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gcc1Q9D4H2 778 aa26.33■■□□□ 1.81
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Triml2E9PW10 424 aa26.33■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mcm2P97310 904 aa26.33■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cog6Q8R3I3 657 aa26.32■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prkar2bP31324 416 aa26.31■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr63B2RY71 923 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 GnpatP98192 678 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Chpf2Q3UU43 768 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dixdc1Q80Y83 711 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TkfcQ8VC30 578 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam83gQ5SWY7 812 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam13aQ8BGI4 693 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Scn4aQ9ER60 1841 aa26.3■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aox2Q5SGK3 1345 aa26.29■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cnksr1A2A9K7 700 aa26.28■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Aplp1Q03157 653 aa26.28■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 DccP70211 1447 aa26.27■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dlg5E9Q9R9 1921 aa26.27■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pnpla7A2AJ88 1352 aa26.27■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sptbn5F6UCX4 1208 aa26.27■■□□□ 1.8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa26.25■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col15a1O35206 1367 aa26.24■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Card10P58660 1021 aa26.24■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Disp3A3KFU9 1347 aa26.23■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm21698A0A087WQP8 267 aa26.23■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm21671G3UY31 267 aa26.23■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stk36Q69ZM6 1316 aa26.22■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Col1a2Q01149 1372 aa26.22■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Bcl9lQ67FY2 1494 aa26.22■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 BcorQ8CGN4 1759 aa26.22■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10471E9Q1C7 252 aa26.21■■□□□ 1.79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CoilQ5SU73 570 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10 ms