Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
Myo5bP21271 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Myo5bP21271 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
Myo5bP21271 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
Myo5bP21271 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Myo5bP21271 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Myo5bP21271 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Myo5bP21271 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Myo5bP21271 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Myo5bP21271 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Myo5bP21271 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Myo5bP21271 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
Myo5bP21271 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Myo5bP21271 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Myo5bP21271 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Myo5bP21271 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Myo5bP21271 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Myo5bP21271 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Myo5bP21271 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Myo5bP21271 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Myo5bP21271 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Myo5bP21271 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Myo5bP21271 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Myo5bP21271 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Myo5bP21271 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Myo5bP21271 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Myo5bP21271 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Myo5bP21271 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Myo5bP21271 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Myo5bP21271 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Myo5bP21271 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Myo5bP21271 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Myo5bP21271 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Myo5bP21271 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Myo5bP21271 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Myo5bP21271 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Myo5bP21271 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Myo5bP21271 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Myo5bP21271 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Myo5bP21271 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Myo5bP21271 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Myo5bP21271 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Myo5bP21271 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Myo5bP21271 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Myo5bP21271 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Myo5bP21271 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Myo5bP21271 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Myo5bP21271 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Myo5bP21271 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myo5bP21271 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Myo5bP21271 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Myo5bP21271 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Myo5bP21271 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myo5bP21271 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Myo5bP21271 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Myo5bP21271 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Myo5bP21271 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Myo5bP21271 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Myo5bP21271 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Myo5bP21271 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Myo5bP21271 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Myo5bP21271 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Myo5bP21271 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Myo5bP21271 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Myo5bP21271 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Myo5bP21271 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Myo5bP21271 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Myo5bP21271 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Myo5bP21271 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Myo5bP21271 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Myo5bP21271 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Myo5bP21271 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Myo5bP21271 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Myo5bP21271 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Myo5bP21271 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Myo5bP21271 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Myo5bP21271 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Myo5bP21271 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Myo5bP21271 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Myo5bP21271 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Myo5bP21271 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Myo5bP21271 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Myo5bP21271 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Myo5bP21271 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Myo5bP21271 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Myo5bP21271 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Myo5bP21271 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Myo5bP21271 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Myo5bP21271 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Myo5bP21271 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Myo5bP21271 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Myo5bP21271 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Myo5bP21271 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Myo5bP21271 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Myo5bP21271 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Myo5bP21271 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Myo5bP21271 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Myo5bP21271 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Myo5bP21271 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Myo5bP21271 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms