Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.36■■■■■ 5.49
Col1a2Q01149 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Col1a2Q01149 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Col1a2Q01149 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Col1a2Q01149 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
Col1a2Q01149 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Col1a2Q01149 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
Col1a2Q01149 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Col1a2Q01149 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Col1a2Q01149 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Col1a2Q01149 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Col1a2Q01149 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Col1a2Q01149 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Col1a2Q01149 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Col1a2Q01149 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Col1a2Q01149 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Col1a2Q01149 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Col1a2Q01149 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Col1a2Q01149 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Col1a2Q01149 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Col1a2Q01149 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Col1a2Q01149 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Col1a2Q01149 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Col1a2Q01149 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Col1a2Q01149 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Col1a2Q01149 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Col1a2Q01149 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Col1a2Q01149 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Col1a2Q01149 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Col1a2Q01149 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Col1a2Q01149 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Col1a2Q01149 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Col1a2Q01149 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Col1a2Q01149 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Col1a2Q01149 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Col1a2Q01149 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Col1a2Q01149 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Col1a2Q01149 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Col1a2Q01149 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Col1a2Q01149 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Col1a2Q01149 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Col1a2Q01149 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Col1a2Q01149 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Col1a2Q01149 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Col1a2Q01149 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Col1a2Q01149 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Col1a2Q01149 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Col1a2Q01149 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Col1a2Q01149 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Col1a2Q01149 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Col1a2Q01149 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Col1a2Q01149 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Col1a2Q01149 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Col1a2Q01149 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Col1a2Q01149 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Col1a2Q01149 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Col1a2Q01149 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Col1a2Q01149 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Col1a2Q01149 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Col1a2Q01149 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Col1a2Q01149 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Col1a2Q01149 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Col1a2Q01149 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Col1a2Q01149 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Col1a2Q01149 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Col1a2Q01149 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Col1a2Q01149 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Col1a2Q01149 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Col1a2Q01149 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Col1a2Q01149 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Col1a2Q01149 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Col1a2Q01149 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Col1a2Q01149 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Col1a2Q01149 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col1a2Q01149 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col1a2Q01149 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col1a2Q01149 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Col1a2Q01149 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Col1a2Q01149 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Col1a2Q01149 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Col1a2Q01149 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Col1a2Q01149 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Col1a2Q01149 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Col1a2Q01149 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Col1a2Q01149 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Col1a2Q01149 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Col1a2Q01149 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Col1a2Q01149 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Col1a2Q01149 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Col1a2Q01149 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Col1a2Q01149 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Col1a2Q01149 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Col1a2Q01149 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Col1a2Q01149 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Col1a2Q01149 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Col1a2Q01149 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Col1a2Q01149 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Col1a2Q01149 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Col1a2Q01149 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Col1a2Q01149 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms