RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc183A2AJB1 534 aa25.01■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pnmal2G3X9N3 661 aa25.01■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnajc10Q9DC23 793 aa25.01■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chl1P70232 1209 aa25■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ak7Q9D2H2 614 aa25■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aifm3Q3TY86 605 aa25■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnh5Q920E3 988 aa25■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Amotl2Q8K371 772 aa24.99■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Siglec1Q62230 1695 aa24.99■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Farp2Q91VS8 1065 aa24.98■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm6aO70546 1401 aa24.98■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col18a1P39061 1774 aa24.98■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wnk3Q80XP9 1757 aa24.97■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GnpatP98192 678 aa24.97■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcna6Q61923 529 aa24.97■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aplp1Q03157 653 aa24.97■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa24.97■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ipo8Q7TMY7 1010 aa24.97■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fmnl2A2APV2 1086 aa24.96■■□□□ 1.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nkx1-2P42580 305 aa24.94■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dzip1Q8BMD2 852 aa24.94■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igsf1Q7TQA1 1317 aa24.93■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atf3Q60765 181 aa24.93■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Amigo3Q8C2S7 508 aa24.93■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TnrQ8BYI9 1358 aa24.92■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SkilQ60665 675 aa24.92■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa24.91■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CanxP35564 591 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Amotl1Q9D4H4 968 aa24.9■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gli3Q61602 1583 aa24.89■■□□□ 1.58
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nid2O88322 1403 aa24.88■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q3TQI7 289 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sv2bQ8BG39 683 aa24.87■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aldh1l2Q8K009 923 aa24.87■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dixdc1Q80Y83 711 aa24.86■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa24.85■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam83gQ5SWY7 812 aa24.85■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim27Q62158 513 aa24.85■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa24.85■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmc1Q8R4P5 757 aa24.85■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif18aQ91WD7 886 aa24.84■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wwc1Q5SXA9 1104 aa24.84■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Triml2E9PW10 424 aa24.83■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map7O88735 730 aa24.83■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chpf2Q3UU43 768 aa24.83■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Phf23Q8BSN5 401 aa24.83■■□□□ 1.57
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tnnt1O88346 262 aa24.82■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppm1gQ61074 542 aa24.82■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnai1Q8C0M8 701 aa24.82■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myo5bP21271 1818 aa24.82■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atf5O70191 283 aa24.81■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LifrP42703 1092 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col15a1O35206 1367 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fgd1P52734 960 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cog6Q8R3I3 657 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Irx6Q9ER75 438 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aox2Q5SGK3 1345 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcc12Q80WJ6 1366 aa24.79■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21698A0A087WQP8 267 aa24.78■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10471E9Q1C7 252 aa24.78■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21671G3UY31 267 aa24.78■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tm6sf1P58749 370 aa24.78■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Brinp3Q499E0 766 aa24.78■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prkar2bP31324 416 aa24.77■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nkx2-3P97334 362 aa24.77■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Simc1E9Q6E9 1354 aa24.76■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa24.76■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cetn4Q8K4K1 168 aa24.76■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam13aQ8BGI4 693 aa24.74■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 OptnQ8K3K8 584 aa24.74■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pnpla7A2AJ88 1352 aa24.74■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dlg5E9Q9R9 1921 aa24.72■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Disp3A3KFU9 1347 aa24.72■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CrklP47941 303 aa24.71■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TkfcQ8VC30 578 aa24.71■■□□□ 1.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr63B2RY71 923 aa24.7■■□□□ 1.54
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Btbd11Q6GQW0 1109 aa24.7■■□□□ 1.54
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Card10P58660 1021 aa24.7■■□□□ 1.54
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ArxO35085 564 aa24.68■■□□□ 1.54
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2d11P24457 504 aa24.68■■□□□ 1.54
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.9 ms