Protein–RNA interactions for Protein: Q8K009

Aldh1l2, Mitochondrial 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1l2Q8K009 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.47■■■■■ 5.03
Aldh1l2Q8K009 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Aldh1l2Q8K009 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Aldh1l2Q8K009 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Aldh1l2Q8K009 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Aldh1l2Q8K009 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Aldh1l2Q8K009 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Aldh1l2Q8K009 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Aldh1l2Q8K009 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Aldh1l2Q8K009 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Aldh1l2Q8K009 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Aldh1l2Q8K009 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Aldh1l2Q8K009 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Aldh1l2Q8K009 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Aldh1l2Q8K009 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Aldh1l2Q8K009 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Aldh1l2Q8K009 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Aldh1l2Q8K009 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Aldh1l2Q8K009 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Aldh1l2Q8K009 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Aldh1l2Q8K009 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Aldh1l2Q8K009 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Aldh1l2Q8K009 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Aldh1l2Q8K009 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Aldh1l2Q8K009 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Aldh1l2Q8K009 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Aldh1l2Q8K009 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Aldh1l2Q8K009 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Aldh1l2Q8K009 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Aldh1l2Q8K009 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Aldh1l2Q8K009 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Aldh1l2Q8K009 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Aldh1l2Q8K009 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Aldh1l2Q8K009 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Aldh1l2Q8K009 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Aldh1l2Q8K009 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Aldh1l2Q8K009 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Aldh1l2Q8K009 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Aldh1l2Q8K009 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Aldh1l2Q8K009 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Aldh1l2Q8K009 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Aldh1l2Q8K009 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Aldh1l2Q8K009 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Aldh1l2Q8K009 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Aldh1l2Q8K009 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Aldh1l2Q8K009 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Aldh1l2Q8K009 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Aldh1l2Q8K009 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Aldh1l2Q8K009 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Aldh1l2Q8K009 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Aldh1l2Q8K009 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Aldh1l2Q8K009 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Aldh1l2Q8K009 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Aldh1l2Q8K009 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Aldh1l2Q8K009 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Aldh1l2Q8K009 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Aldh1l2Q8K009 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Aldh1l2Q8K009 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Aldh1l2Q8K009 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Aldh1l2Q8K009 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Aldh1l2Q8K009 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Aldh1l2Q8K009 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Aldh1l2Q8K009 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Aldh1l2Q8K009 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Aldh1l2Q8K009 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Aldh1l2Q8K009 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Aldh1l2Q8K009 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Aldh1l2Q8K009 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Aldh1l2Q8K009 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Aldh1l2Q8K009 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Aldh1l2Q8K009 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Aldh1l2Q8K009 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Aldh1l2Q8K009 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Aldh1l2Q8K009 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Aldh1l2Q8K009 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Aldh1l2Q8K009 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Aldh1l2Q8K009 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Aldh1l2Q8K009 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Aldh1l2Q8K009 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Aldh1l2Q8K009 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Aldh1l2Q8K009 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Aldh1l2Q8K009 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Aldh1l2Q8K009 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Aldh1l2Q8K009 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Aldh1l2Q8K009 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Aldh1l2Q8K009 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Aldh1l2Q8K009 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Aldh1l2Q8K009 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Aldh1l2Q8K009 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Aldh1l2Q8K009 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Aldh1l2Q8K009 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Aldh1l2Q8K009 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Aldh1l2Q8K009 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Aldh1l2Q8K009 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Aldh1l2Q8K009 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Aldh1l2Q8K009 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Aldh1l2Q8K009 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Aldh1l2Q8K009 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Aldh1l2Q8K009 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Aldh1l2Q8K009 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms