RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C NUT1P53114 1132 aa3.28□□□□□ -1.88
HDA3YPR179C GPT2P36148 743 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C SDH1Q00711 640 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C HAT1Q12341 374 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C NSI1Q12457 570 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YAF9P53930 226 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C ORC3P54790 616 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C MEC3Q02574 474 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YMR074CQ04773 145 aa3.27□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C SEG2P34250 1132 aa3.26□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C LRG1P35688 1017 aa3.26□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C RCM1P53972 490 aa3.26□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C DFG16Q99234 619 aa3.26□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C OYE3P41816 400 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C PMT7Q06644 662 aa3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C RNQ1P25367 405 aa3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C POL12P38121 705 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C ECM2P38241 364 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YHL008CP38750 627 aa3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C ALT1P52893 592 aa3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C RVS167P39743 482 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C SAM37P50110 327 aa3.24□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C PRP43P53131 767 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-DR6P0CX70 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-ER1P0CX71 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-LR2P0CX72 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-PLP0CX73 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-JR1P0CX74 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-LR3P0CX75 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-ML2P0CX76 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C PPX1P38698 397 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-GR1Q12085 440 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TSA1P34760 196 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C EXO5P38289 585 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C REI1P38344 393 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YHL050CP38721 697 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YHR219WP38900 624 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YCS4Q06156 1176 aa3.23□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C ADP1P25371 1049 aa3.22□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C HSP78P33416 811 aa3.22□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C MET4P32389 672 aa3.21□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C VPS35P34110 944 aa3.21□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C NNK1P36003 928 aa3.21□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C TRE1Q08919 783 aa3.21□□□□□ -1.89
HDA3YPR179C YCR015CP25616 317 aa3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C MCM5P29496 775 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SMY2P32909 740 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C NEM1P38757 446 aa3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C STM1P39015 273 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C PEX7P39108 375 aa3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C MON1P53129 644 aa3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C CDA2Q06703 312 aa3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C YVC1Q12324 675 aa3.21□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C YGR045CP53229 120 aa3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C GAS1P22146 559 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C EAR1Q03212 550 aa3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SSY1Q03770 852 aa3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C TOS4Q06266 489 aa3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C WHI5Q12416 295 aa3.2□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C NFS1P25374 497 aa3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C PRP40P33203 583 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C THI80P35202 319 aa3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C RDH54P38086 958 aa3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SHU2P38957 223 aa3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SLS1P42900 643 aa3.19□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C UGA4P32837 571 aa3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C DAK2P43550 591 aa3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C ESC8Q08119 714 aa3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C PRP6P19735 899 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C YKL077WP36081 392 aa3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C ELA1P53861 379 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C ULP1Q02724 621 aa3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C AVO1Q08236 1176 aa3.18□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C HEM13P11353 328 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C VMA4P22203 233 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C MSH3P25336 1018 aa3.17□□□□□ -1.9
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