RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W EST2Q06163 884 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W PEX19Q07418 342 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W KEX1P09620 729 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W MYO3P36006 1272 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W GSM1P42950 618 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR196WYMR196W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RAD51P25454 400 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YKU70P32807 602 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RTS1P38903 757 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RRP8P38961 392 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W LEM3P42838 414 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W DPL1Q05567 589 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W ELM1P32801 640 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W EPL1P43572 832 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RDS1P25611 832 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MAL33P38157 468 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RVS167P39743 482 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W COG8Q04632 607 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W TFC6Q06339 672 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MPH3P0CE00 602 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W FRS2P15625 503 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W ANP1P32629 500 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W APL6P46682 809 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PIP2P52960 996 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PEX14P53112 341 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RPN12P32496 274 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W AKR1P39010 764 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W GDE1Q02979 1223 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RFC5P38251 354 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W BUD6P41697 788 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W TAF1P46677 1066 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PUS6P53294 404 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W APC11Q12157 165 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PRO3P32263 286 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W UBX5Q06682 500 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W ISW2Q08773 1120 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YPL260WQ08977 551 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RAD61Q99359 647 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.31□□□□□ -1.56not detected
YMR196WYMR196W CBP3P21560 335 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W SHC1P39000 512 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W DIT2P21595 489 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W AFG2P32794 780 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W SAP190P36123 1033 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RKM3P38222 552 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W VID27P40157 782 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W CCT5P40413 562 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W CSM2P40465 213 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MAK31P23059 88 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RRP14P36080 434 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RSM25P40496 264 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YJL171CP46992 396 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RIT1P23796 513 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W DID4P36108 232 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RPN10P38886 268 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W SEC27P41811 889 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YOR111WQ99210 232 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MYO1P08964 1928 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W CDC6P09119 513 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PGI1P12709 554 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W HCA4P20448 770 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W BMH2P34730 273 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PIM1P36775 1133 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W DCS2Q12123 353 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W AIM20P40451 204 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YLL054CQ12244 843 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W VPS1P21576 704 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RSC1P53236 928 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RNR3P21672 869 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W STV1P37296 890 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MAL31P38156 614 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W MTC3P53077 123 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W RXT2P38255 430 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W ERP2P39704 215 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W PCI8P40512 444 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR196WYMR196W LCD1Q04377 747 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 94.8 ms