RNA–Protein interactions for RNA: YGL171W

ROK1, Transcript of RNA-dependent ATPase, yeast

Gene ROK1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROK1	YGL171W	AGE1	Q04412	482 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SPO75	Q07798	868 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	FOB1	O13329	566 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	RTA1	P53047	317 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SPC105	P53148	917 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SAS4	Q04003	481 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	BSC2	Q05611	235 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	NUD1	P32336	851 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	THI73	Q07904	523 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	FMP25	Q08023	583 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	NPR1	P22211	790 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SWI3	P32591	825 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	YBR071W	P38243	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PFD1	P46988	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PEX14	P53112	341 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	RSC4	Q02206	625 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	EEB1	Q02891	456 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	UME1	Q03010	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	UGO1	Q03327	502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	INH1	P01097	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	GCR1	P07261	785 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SSH4	P32343	579 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	UGA4	P32837	571 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	TFC3	P34111	1160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	EXO84	P38261	753 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PIP2	P52960	996 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	TAF8	Q03750	510 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	ARE1	P25628	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	EUG1	P32474	517 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	HSE1	P38753	452 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	MAL11	P53048	616 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	ERP6	P53198	216 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	ALR1	Q08269	859 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SWI5	P08153	709 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PLC1	P32383	869 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PEX6	P33760	1030 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	BET3	P36149	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	JNM1	P36224	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PIC2	P40035	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	YNL193W	P53870	558 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	MET14	Q02196	202 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	EAF1	Q06337	982 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	RTP1	Q12751	981 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	MRPL33	P20084	86 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SMC1	P32908	1225 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	TFC4	P33339	1025 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	MUM2	P38236	366 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	NDE1	P40215	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	IRR1	P40541	1150 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	HUL4	P40985	892 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	ISU2	Q12056	156 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	GAL1	P04385	528 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	VPS5	Q92331	675 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	NHA1	Q99271	985 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ROK1	YGL171W	DNA2	P38859	1522 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	MEF1	P25039	761 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	AGP1	P25376	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	MRP8	P35719	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	VBA5	P36172	582 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	SEA4	P38164	1038 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	HXT5	P38695	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	GEM1	P39722	662 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	HXT8	P40886	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	UBA2	P52488	636 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	YML131W	Q03102	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	SHE9	Q04172	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	TRE2	Q08693	809 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	HIR3	P47171	1648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
ROK1	YGL171W	VAC17	P25591	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROK1	YGL171W	PTH2	P34222	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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