RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	BUD2	P33314	1104 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	UBP12	P39538	1254 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SMC5	Q08204	1093 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	DLD1	P32891	587 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ATG36	P46983	293 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PUP2	P32379	260 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CST26	P38226	397 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	IOC3	P43596	787 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PEX15	Q08215	383 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	KAR3	P17119	729 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RXT2	P38255	430 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MLH2	Q07980	695 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CLB3	P24870	427 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PSY2	P40164	858 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RUP1	Q12242	671 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	UBP13	P38187	747 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	BSD2	P38356	321 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	NNF2	P53253	936 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	THI3	Q07471	609 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SEM1	O94742	89 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PFF1	P38244	976 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	BRL1	P38770	471 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	VID28	P40547	921 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	FAR11	P53917	953 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	INM2	Q05533	292 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TAH18	Q12181	623 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	NUP145	P49687	1317 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RFC5	P38251	354 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YHL017W	P38745	532 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MPH3	P0CE00	602 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ACE2	P21192	770 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TFC4	P33339	1025 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SSP1	P38871	571 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	DIT2	P21595	489 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RAM2	P29703	316 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RAD24	P32641	659 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SLA1	P32790	1244 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RSC1	P53236	928 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	LCD1	Q04377	747 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YLR271W	Q06152	274 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	RED1	P14291	827 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PEP3	P27801	918 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	ORC6	P38826	435 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	DSE4	P53753	1117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	YIL092W	P40497	633 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	SFB2	P53953	876 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DNF2	YDR093W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	DEP1	P31385	405 aa		5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	TCD1	P38756	429 aa		5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	VHR2	P40041	505 aa		5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	YFH7	P43591	353 aa		5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
DNF2	YDR093W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56

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