RNA–Protein interactions for RNA: YBR163W

EXO5, Transcript of Mitochondrial 5'-3' exonuclease and sliding exonuclease, yeast

Gene EXO5, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO5	YBR163W	GIS4	Q04233	774 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	UFD2	P54860	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	MDJ2	P42834	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	YBT1	P32386	1661 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	SSM4	P40318	1319 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO5	YBR163W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	TED1	P40533	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	PRY1	P47032	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	NUT2	Q06213	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	FRT1	Q99332	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	FUS1	P11710	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	GIP2	P40036	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	ALD3	P54114	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	BNR1	P40450	1375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	TFA2	P36145	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YHL050C	P38721	697 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	RRM3	P38766	723 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YHR219W	P38900	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YNL011C	P53980	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	RSC4	Q02206	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	SRB8	P25648	1427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	SKN7	P38889	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	MNL2	Q12205	849 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	SLP1	Q12232	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	TAT1	P38085	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	GAS5	Q08193	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	BUD9	P53226	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	CTR9	P89105	1077 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	CDC55	Q00362	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	BSC2	Q05611	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	MCA1	Q08601	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YJR124C	P47159	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	SOG2	Q08817	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	YHL008C	P38750	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	NEO1	P40527	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	GUP1	P53154	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO5	YBR163W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	COB	P00163	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	PAN5	P38787	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	LSB6	P42951	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	GLO4	Q12320	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	SAC7	P17121	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	THI12	P42883	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	THI5	P43534	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	THI11	P47183	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	THI13	Q07748	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	AI3	P03877	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	FET4	P40988	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	LEM3	P42838	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	DUR3	P33413	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	DSE4	P53753	1117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	FLP1	P03870	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	YAP3	P38749	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	SAM37	P50110	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	NPR1	P22211	790 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	SFA1	P32771	386 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	IPL1	P38991	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	WHI5	Q12416	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	PPX1	P38698	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	MON1	P53129	644 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	YML020W	Q03722	664 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO5	YBR163W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 346.1 ms